Portál:Lékařská biologie a genetika

     Lékařská biologie a genetika

Užitečné odkazy

Zkouškové otázky Portál:Otázky z biologie a lékařské genetiky (1. LF UK, VL) Portál:Otázky z biologie a lékařské genetiky (1. LF UK, ZL) Portál:Otázky z klinické genetiky ke státní zkoušce z pediatrie (3. LF UK, VL) Odkazy MEFANET portál Lékařská genetika MEFANET portál Biologie Všechny články z kategorie Molekulární biologie Komentované internetové odkazy Komentovaný seznam literatury Atlas Patologických karyotypů (1. LF UK) (Poznávačka) Přímo z WikiSkript spouštěnou Java aplikaci, která se vztahuje k tomuto tématu, najdete zde. Program, v němž si můžete vyzkoušet vyšetření karyotypu. Aktuální genetika Genomika v medicíně

Doporučená literatura 1. LF UK OTOVÁ, Berta, et al. Lékařská biologie a genetika (I.díl). 2. vydání. Praha : Karolinum, 2015. ISBN 9788024628356. KOHOUTOVÁ, Milada, et al. Lékařská biologie a genetika. (II. díl). 1. vydání. Praha : Karolinum, 2012. 202 s. ISBN 978-80-246-1873-9. PANCZAK, Aleš, et al. Lékařská biologie a genetika (III. díl). 1. vydání. Praha : Karolinum, 2013. 146 s. ISBN 9788024624150. KOTLAS, Jaroslav, et al. Návody a úkoly k praktickým cvičením z lékařské biologie a genetiky. 2. vydání. Praha : Karolinum, 2011. 148 s. ISBN 978-80-246-1933-0. SNUSTAD, D. Peter a Michael J SIMMONS. Genetics. 6. vydání. Hoboken : Wiley, 2012. 766 s. ISBN 978-1-118-09242-2. PRITCHARD, Dorian J a Bruce R KORF. Základy lékařské genetiky. 1. vydání. Praha : Galén, 2007. 182 s. ISBN 978-80-7262-449-2.

Články z biologie a genetiky

Formální a obecná genetika Historie genetiky Významné objevy a osobnosti (Genetika v datech • Historie epigenetiky) Monogenní dědičnost Základní pojmy Alelické interakce • Alely • Chromozom • Diploidní • Fenotyp • Gen • Genofond • Genom • Genomická DNA • Genotyp • Geny pro funkční RNA • Haploidní • Haplotyp • Hemizygot • Heterozygot • Histony • Homozygot • Lidský genom a jeho variabilita • Lokus • Plod • Polymorfismus • Pseudogen • RNA - typy, stavba, funkce • Struktura a funkce genu • Strukturní gen • Znak Pravidla mendelovské dědičnosti Dihybridismus, interakce nealelních genů, polyhybridismus • Dihybridismus • Interakce nealelních genů • Mendelovy pokusy • Mendelovy zákony dědičnosti • Mnohotná alelie • Monohybridismus • Parentální, F1, F2 generace • Zpětné křížení • Základní zákony genetiky Výjimky z mendelovské dědičnosti Expresivita • Fenokopie • Genetická výbava mitochondrií • Genokopie • Genomický imprinting • Genová vazba • Matroklinita • Matroklinní (mitochondriální) dědičnost • Nestabilita repetitivních sekvencí • Penetrance • Pleiotropie • Uniparentální disomie Oligogenní, polygenní a multifaktoriální dědičnost Polygenní dědičnost Multifaktoriální dědičnost Expresivita • Heritabilita • Penetrance Molekulární genetika Nukleové kyseliny a proteosyntéza Centrálna dogma molekulárnej genetiky Biosyntéza nukleových kyselin a proteosyntéza v mitochondriích • Biosyntéza nukleových kyselin • Chromatin • DNA • SsDNA • DsDNA • DNA mitochondrií • Interakce DNA s proteiny • Rekon • Repetitivní sekvence v genomu člověka • Replikace DNA • Replikon • Replizom • Struktura DNA • DNA sekvence proteinotvorné a neproteinotvorné • MiRNA • mRNA • "nekódující" RNA • Nukleové kyseliny • Operon • Signální sekvence • Polymorfismy nukleových kyselin • Reverzní transkriptáza • RNA interference • RNA - struktura, typy • Řízení genové exprese a proteosyntézy • rRNA • Telomery a telomerasa • tRNA Exprese genu • Glykosylace • Inhibitory • Posttranskripční úpravy • Posttranslační glykosylace proteinů • Posttranslační úpravy a targeting proteinů • Proteiny Selenocystein a pyrrolyzin • Regulace genové exprese u eukaryot • Regulace genové exprese u prokaryot • Ribosom • Signální sekvence polypeptidu, volné a vázané ribozómy • Transkripce • Transkripční faktory • Transkripční faktory s homeodoménou • Translace membránových a exkrečních proteinů • Translace Genové inženýrství • Metody sekvencování • Rekombinantní DNA • Restriktázy Mutace a reparace Molekulární podstata dědičných chorob • Mutace • Reparační mechanismy organismu a jejich genetická kontrola Genotyp a jeho variabilita, mutace a rekombinace Epigenetika Epigenetika a lidská onemocnění • Epigenetika • Genomický imprinting • Genový imprinting a lidské patologie • Histonový kód • Metylace DNA • Modifikace histonů • Uniparentální disomie Angelmanův syndrom • Beckwithův-Wiedemannův syndrom • Prader-Williho syndrom • Laboratorní metody DGGE a TGGE • Elektroforesa sérových proteinů • Elektroforéza nukleových kyselin • Heteroduplexová analýza • Identifikace restrikčních fragmentů • Izolace DNA • Metody analýzy nukleových kyselin • Polymerasová řetězová reakce • Polymorfismus délky restrikčních fragmentů • Polymorfismus konformace jednoduchých řetězců (SSCP) • Southernův blotting • Vyhledávání mutací Fyzikální metody genového mapování • Genové manipulace a genové inženýrství • Molekulárně-biologická diagnostika v onkologii Komparativní genomová hybridizace DNA čipy • Hybridizace in situ Cytogenetika Jádro Metafázní chromosom Autosomy • Centromera • Chromosom X • Chromosom Y • Chromosom • Chromosomální determinace pohlaví • Eukaryotické chromosomy • gen SRY • Heterochromosomy • Lidský karyotyp • Stavba metafázního chromosomu • Typy metafázních chromosomů Vyšetření chromosomů Barvení chromozomů • Identifikace chromosomů • Materiál k vyšetření chromosomů • Phytohaemagglutinin Chromosomální aberace Chromozomální abnormality (Chromozomální mozaika • Klastogeny • Numerické chromosomové aberace • Prenatální screening • Příčiny vzniku chromosomálních aberací • Strukturní chromosomové aberace • Subtelomerické přestavby chromozomů • Získané chromosomové aberace) Syndromy podmíněné aneuploidií autosomů (Downův syndrom • Edwardsův syndrom • Patauův syndrom) Syndromy podmíněné aneuploidií gonosomů (Klinefelterův syndrom • Turnerův syndrom • Syndrom 47,XXX • Syndrom 47,XYY) Mikrodeleční syndromy (Angelmanův syndrom • DiGeorgův syndrom • Prader-Williho syndrom • Williamsův syndrom) Syndromy chromozomální nestability (Ataxia telangiectasia • Bloomův syndrom • Fanconiho anemie) Nádorová cytogenetika (Chromozomové aberace v etiologii neoplázií) Strukturní chromozomové aberace (Syndrom Cri du chat • Wolfův-Hirschhornův syndrom) Buněčný cyklus Buněčný cyklus a jeho fáze Buněčný cyklus Regulace buněčného cyklu Indukční faktory • Kolcemid • Mutátorové geny • (Proto)onkogeny • Replikativní stárnutí • Tumor-supresorové geny Mitóza Mitóza Meióza Crossing-over • Gameta • Gametogeneze • Meióza • Poruchy meiózy • Spermie Buněčná biologie Buňka • Centromera • Mitochondrie • Mitofusin • Organely • Zonula occludens Rozdíly mezi eukaryoty a prokaryoty Srovnání eukaryot a prokaryot Genetika prokaryot Prokaryota • Regulace genové exprese u prokaryot • Význam a struktura chromosomů prokaryot Genetika bakterií Bakterie (Bakteriální chromozom • Operonový model • Plazmid • Reprodukce • Struktura) Parasexuální děje u bakterií Konjugace • Transdukce • Transformace • Vegetatívne rozmnožovanie Genetika virů Viry • Biochemie virů • DNA viry • Onkogenní viry • Reprodukce DNA virů • Reprodukce RNA virů • RNA viry • Transdukce • Virion Buněčná signalizace Buněčná signalizace • Poruchy signalizace apoptózy v nádorových buňkách KIT Populační genetika Populační genetika Genetická heterogenita a polymorfismy bílkovin • Genetická zátěž populace • Hardy-Weinbergova rovnováha • Inbred, příbuzenské sňatky a jejich rizika • Koeficient inbreedingu • Koeficient příbuznosti • Mutace z populačního hlediska, četnost mutací • Populace • Populační polymorfismy Evoluční genetika Evoluce • Buněčná teorie • Definice života • Evoluce a speciace na chromosomální úrovni • Evoluce a speciace na molekulární úrovni • Evoluce druhu Homo sapiens • Evoluce genů • Evoluce ontogeneze a životního cyklu • Evoluce sekvence DNA • Evoluční tahy • Genetické mechanismy evoluce • Genetický drift • Genetický drift v malé populaci • Genový tok • Hominizace • Migrace • Mutace • Přirozený výběr • Selekce • Subletálny gén • Vznik a vývoj druhů • Vznik nových genů v evoluci

Genetika člověka Využití pravidel mendelovské genetiky v genetice člověka Antigen Dvojčecí metoda • Genealogie • Klinická genetika • Proband • Rodinná anamnéza Genetické metody vazbové analýzy Genetické mapy a jejich význam • Mapa lidského genomu • Mapování genomu Monogenně děděné znaky Dědičnost krevně skupinových systémů • Hemoglobiny a jejich dědičnost • Monogenně dědičné choroby • Monogenně dědičné poruchy reparace • Polymorfismus délky restrikčních fragmentů • Repetitivní sekvence • Sekvence s nízkou repetivitou • Syndromy předčasného stárnutí • Transplantační antigeny Typy dědičnosti Autosomálně dominantní dědičnost • Autosomálně recesivní dědičnost • Gonozomální dědičnost • Gonozomálně dominantní dědičnost • Gonozomálně recesivní dědičnost • Matroklinní dědičnost • Mimojaderná dědičnost • X-vázaná dědičnost • Y-vázaná dědičnost Hemoglobinopatie • Struktura hemoglobinu‎ Ontogenetika Embryonální vývoj • Fetální vývoj • Genetické příčiny procesu stárnutí a smrti • Genová kontrola a význam apoptózy v ontogenezi • Genová kontrola diferenciace v ontogenezi • Postnatální vývoj • Preembryonální vývoj • Stárnutí organismu Apoptóza a klinické důsledky poruch její regulace • Apoptóza • Diferenciace • gen SRY • Inaktivace chromozomu X • Morfogen • Ontogeneze pohlaví u savců • Pseudoautosomální oblast Imunogenetika Autoimunitní onemocnění • Dědičné poruchy imunity • Genetika Ig, B a T receptorů • Genetika transplantací, transplantační zákony • Genová kontrola tvorby protilátek • Hlavní histokompatibilitní komplex • Imunodeficience • Imunokompetentní buňky • Lektiny • Transplantace • Transplantační zákony • Využití monoklonálních protilátek v medicíně Dědičnost krevně skupinových systémů (AB0 systém • Rh systém • MN systém) •AB0 inkompatibilita • Fetální erytroblastóza Genetika komplexních znaků Asociační studie • Ekogenetika infekčních onemocnění • Genetická analýza komplexních znaků • Genetická koncepce v psychiatrii • Genetika "civilizačních" onemocnění • Genetika neurodegenerativních onemocnění • Genetika závislostí na návykových látkách • Vazebné studie Klinická genetika Úkoly a vymezení oboru Etické a právní aspekty lékařské genetiky • Klinická genetika • Prekoncepční prevence dědičných chorob a vad • Skrínink dědičných chorob Metody lékařské genetiky Amniocentéza • Asistovaná reprodukce • Buněčné kultury • Fetoskopie • In Vitro Fertilizace • Indikace chromozomálního vyšetření • Kordocentéza • M-FISH Odběr choriových klků • Preimplantační genetická diagnostika • Prenatální diagnostika • Etické, sociální a právní aspekty genetiky Biobanky • Etické aspekty genetického testování • Etické aspekty výzkumu kmenových buněk • Geneticky modifikované organismy • Koncepce GE3LS • Právní aspekty genetiky Geneticky podmíněné choroby Obecně: Molekulární podstata dědičných chorob • Postnatální prevence dědičných chorob • Prekoncepční prevence dědičných chorob a vad • Principy terapie dědičných chorob • Přímá diagnostika dědičných chorob analýzou nukleových kyselin • Somatické a gametické chromosomální aberace Příklady: Achondroplasie • Albinismus • Alportův syndrom • Amelogenesis imperfecta • Bartterův syndrom • Charcot Marie Tooth • Cockaynův syndrom • Criglerův-Najjarův syndrom • Cystická fibróza • Dandy-Walker syndrom • Dentinogenesis imperfecta • Diastrofický dwarfismus • Duchennova muskulární dystrofie • Dědičné metabolické poruchy • Ehlers-Danlosův syndrom • Fabryho choroba • Fenylketonurie • Hemofilie • Hemoglobinopatie • Hereditární osteoonychodysplázie • Huntingtonova choroba • Inkontinentia pigmenti • Larsenův syndrom • Marfanův syndrom • Mukopolysacharidózy (I. typ • II. typ • III. typ • IV. typ a další) • MOCE • Ochronóza • Osteogenesis imperfecta • Polycystická choroba ledvin/autosomálně dominantní • Polycystická choroba ledvin/autosomálně recesivní • Pseudohermafroditismus • Retinitis pigmentosa • SED • Syndrom fragilního X • Tay-Sachsova choroba • Von Willebrandova choroba • Wilsonova choroba • Onkogenetika Biologické vlastnosti nádorů Benigní • Maligní • Biologie onkogeneze • Charakteristika nádorového bujení • Chemická karcinogeneze • Chromozomové aberace v etiologii neoplázií • Filadelfský chromozom • Fyzikální karcinogeneze • Kancerogeneze • Karcinogeny • Karcinom pankreatu (genetika) • Mutageny a mutageneze • Mutatorové geny, stabilita buněčného genomu • Poruchy apoptosy • (Proto)onkogeny • Tumor supresorové geny • Virová karcinogeneze Hereditární nádorové syndromy Ataxia telangiectasia • Bannayan-Riley-Ruvalcabaův syndrom • Bloomův syndrom • Cowdenův syndrom • Fanconiho anémie • Gardnerův syndrom • Lynchův syndrom • MEN syndrom • Neurofibromatóza • Peutz-Jeghersův syndrom • Retinoblastom • Syndrom Li-Fraumeni • P53 • Wilmsův tumor Vrozené vývojové vady Vrozené vývojové vady Fetální alkoholový syndrom • Teratogeneze • Teratogeny • Teratologie • Záchyt a prevence vrozených chromosomálních odchylek Vrozené vady pohybového aparátu Adamsův-Oliverův syndrom • Aplasia fibulae congenita • Aplasia radii congenita • Arachnodaktylie • Arthrogryposis multiplex congenita • Fokomelie • Pes equinovarus congenitus • Polandova anomálie • Polydaktylie • Proximální fokální femorální deficience • PFFD • Pseudoarthrosis tibiae congenita • Spondyloepifyzární dysplázie • Synostosis radioulnaris congenita • Talipomanus • Tanatoforický dwarfismus Vrozené srdeční vady Aortální stenóza • Defekt septa komor • Defekt septa síní • Eisenmengerův syndrom • Fallotova tetralogie • Hypoplastické levé srdce • Koarktace aorty • Otevřená Botallova dučej • Stenóza plicnice • Transpozice velkých cév Vrozené vývojové vady dýchací soustavy Kongenitální laryngeální stridor Vrozené vady ucha Vrozené vady boltce • Vrozené vady vnitřního ucha • Vrozené vady zevního a středního ucha Vrozené vady oka Rozštěpové vady obličeje Typické rozštěpy obličeje • Atypické rozštěpy obličeje • Miller-Diekerův syndrom Vrozené vady centrální nervové soustavy Dandyova-Walkerova malformace • Holoprozencefalie • Chiariho malformace • Meningokéla Vrozené vývojové vady ledvin Polycystická choroba ledvin/autosomálně dominantní • Polycystická choroba ledvin/autosomálně recesivní Kraniofaciální syndromy Vrozená brániční kýla Ekologie a ekogenetika Ekogenetika a Farmakogenetika Ekologie, ekogenetika Ekotoxikologie • Farmakogenetika • Genotyp a prostředí • Interakce genů a prostředí • Mutagenní a teratogenní faktory životního prostředí • Nutrigenetika • Toxikogenetika Experimentální genetika Modely lékařské genetiky a výzkumu Jednobuněčné modely • Arabidopsis thaliana • Caenorhabditis elegans • Danio rerio • Drosophila melanogaster • Mus musculus • Pan troglodytes • Rattus norvegicus • in silico - počítačové modely • in vitro - buněčné a tkáňové kultury • Kongenní kmen • Konsomický kmen • Metody genetické analýzy v experimentu a lidské genetice Metody lékařské genetiky a výzkumu Hybridizační pokus • Interkros Bioinformatika v genetice Analýza a porovnávání sekvencí biomolekul • Bioinformatické postupy v genomice • Fylogenetická systematika • Predikce prostorové konformace biomolekul • ¨Tvorba fylogenetických stromů Genomika, transkriptomika, proteomika DNA knihovny • Dvojrozměrná elektroforéza • Genomika • Hmotová spektrometrie • Izoelektrická fokusace • Kapalinová chromatografie • Lidský genom a jeho variabilita • Mapování genomu • Preanalytická příprava vzorku • Proteinové "čipy" • Proteomika • Transkriptomika • Tříbodový pokus Experimentální terapie Genová terapie Možnosti a perspektivy genové terapie • Možnosti genové terapie nádorů • Vektory Kmenové buňky Klonování • Tři cesty klonování Genetické inženýrství a biotechnologie Biochemie genového inženýrství • Genetické modifikace • Genové manipulace a genové inženýrství • Genové inženýrství • Identifikace buněk • Izolace buněk • Kultivace buněk a tkání in vitro, význam v medicině • Plazmid • Pomnožení a exprese izolovaného genu v hostitelské buňce • Rekombinantní DNA • Syntéza umělé DNA • Transgenní zvířata • Vkládání genů pomocí bílkovin s motivem zinkových prstů Nezařazené Asociační studie • Bayesova analýza • Binderův syndrom • Böökův syndrom • Crouzonův syndrom • DeLangeové syndrom • DNA fingerprinting • Gen Sonic Hedgehog • Genetika • ‎Goldenharův syndrom • He-La buňky • Metody genetické analýzy v experimentu a lidské genetice • Presymptomatická diagnostika a prevence nádorů • Smithův-Lemliův-Opitzův syndrom

Pracoviště

• Ústav biologie a lékařské genetiky 1.LF UK a VFN
• Ústav biologie a lékařské genetiky 2.LF UK a FN Motol
• Ústav obecné biologie a genetiky 3. LF UK
• Ústav lékařské genetiky Lékařské fakulty UK v Plzni
• Ústav lékařské biologie a genetiky Lékařské fakulty UK v Hradci Králové
• Ústav biologie Lékařské fakulty Masarykovy univerzity v Brně
• Ústav lékařské genetiky a fetální medicíny, LF UP v Olomouci a FN Olomouc
• Ústav molekulární genetiky AV ČR, v.v.i.