Signální sekvence

Signální sekvence jsou krátké, několikanukleotidové sledy s velmi specifickou informací. Jsou velmi významné pro funkci nukleových kyselin.

Základní informace[upravit | editovat zdroj]

Signální peptidáza

Členění

sekvence označující začátek replikace (v D kličce mitochondriální DNA),
sekvence ovládající transkripci (umístěné před, za či dokonce uvnitř oblasti, kterou ovládají).

Dříve objevené byly označovány podle objevitelů Hogness^[1] (eukaryota), Pribnow ^[2] (prokaryota), TATA box (umožňuje, aby transkripce začala od adeninu obklopeného skupinou pyrimidinových bazí, nachází se cca 30 nukleotidů za TATA ve směru od 5´do 3´). Adenin se skupinou pyrimidinových bazí tvoří tzv. startovací nukleotid (+1)

Funkce

důležitá pro tvorbu čepičky mRNA (sled 5 nukleotidů za startovacím nukleotidem CATTC) a signál pro polyadenylaci konce mRNA AATAAA,
zajišťují rozpojení a spojení DNA na předem určených místech,
mají schopnost měnit prostorové uspořádání a uplatnit svůj informační obsah - tzv. palindromy
úplné,

neúplné palindromy (pouze částečně komplementární).

Středně repetitivní sekvence[upravit | editovat zdroj]

Nachází se samostatně nebo ve skupinách rozptýlené po celém genomu. Jsou transkribované do RNA, jejich funkce však ještě není přesně známa.

Mohou být dlouhé nebo krátké. Obsahují sekvence Alu, ve kterých se nachází restrikční místa pro Alu I restrikční enzym.

V lidském haplotypu se nachází skupina zhruba 300 000–500 000 kopií (5 % DNA) sekvencí. Zmíněné sekvence mají dimerní charakter, obsahují dvě za sebou následující navzájem podobné sekvence.

Odkazy[upravit | editovat zdroj]

Související články[upravit | editovat zdroj]

Reference[upravit | editovat zdroj]

↑ LIFTON, R P, M L GOLDBERG a R W KARP, et al. The organization of the histone genes in Drosophila melanogaster: functional and evolutionary implications. Cold Spring Harb Symp Quant Biol [online]. 1978, vol. 42 Pt 2, s. 1047-51, dostupné také z <https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/98262>. ISSN 0091-7451.
↑ PRIBNOW, D. Nucleotide sequence of an RNA polymerase binding site at an early T7 promoter. Proc Natl Acad Sci U S A [online]. 1975, vol. 72, no. 3, s. 784-8, dostupné také z <https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC432404/?tool=pubmed>. ISSN 0027-8424.

Použitá literatura[upravit | editovat zdroj]

OTOVÁ, Berta. Lékařská biologie a genetika : 2.díl. Praha 2008 vydání. Nakladatelství karolinum, 2008. ISBN 978-80-246-1594-3.

[1] LIFTON, R P, M L GOLDBERG a R W KARP, et al. The organization of the histone genes in Drosophila melanogaster: functional and evolutionary implications. Cold Spring Harb Symp Quant Biol [online]. 1978, vol. 42 Pt 2, s. 1047-51, dostupné také z <https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/98262>. ISSN 0091-7451.

[2] PRIBNOW, D. Nucleotide sequence of an RNA polymerase binding site at an early T7 promoter. Proc Natl Acad Sci U S A [online]. 1975, vol. 72, no. 3, s. 784-8, dostupné také z <https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC432404/?tool=pubmed>. ISSN 0027-8424.

[1]

[2]