Regulace genové exprese u eukaryot
Eukaryotní buňky mají daleko složitější strukturu než buňky prokaryot. Systém membrán odděluje jádro od cytoplasmy, látková přeměna probíhá ve funkčně specializovaných organelách (mitochondrie, ER). Toto rozdělení vyžaduje i jinou regulaci jednotlivých kroků proteosyntézy a tvorby buněčných struktur.
Regulace exprese genů u eukaryot je podstatně komplexnější a mnohotvárnější než u prokaryot. Transkripce a translace probíhají na jiných místech buňky a v časové posloupnosti. Syntéza polypeptidů je diferencována v závislosti na tom, zda budou užívány uvnitř buňky nebo exportovány.
V mnohobuněčném organismu je exprese genů regulována zprostředkovaně systémem signálních molekul, jež zajišťují předávání informací mezi buňkami (a tím i informace o stavu vnějšího a vnitřního prostředí). Pro přenos těchto signálů jsou buňky vybaveny specifickými membránovými a cytoplazmatickými receptory.
Exprese lidských genů je komplexně regulována dle potřeb buňky, které závisejí mimo jiné na typu a vývojovém stádiu buňky.
Po splynutí vajíčka a spermie vzniká totipotentní zygota – tyto buňky jsou schopny se dělit a produkovat jakékoli diferencované buňky organismu. Po několika děleních se začnou specializovat. DNA v každé lidské buňce obsahuje všechny geny genomu, ale ve většině buněk je aktivní jen část v závislosti na vývojovém stádiu a tkáni a postupující diferenciaci, buňky exprimují cca 15% svých genů.
Některé geny se exprimují ve všech buňkách organismu (housekeeping geny) – jejich produkty (histony, ribosomální proteiny) jsou životně důležité pro buňky
k regulaci exprese genů dochází na několika úrovních:
- na úrovni chromosomu
- změna struktury
- efekt pozice = přenos genů z euchromatinu na heterochromatin = změna funkce
- amplifikace = zmnožení počtu transkribovaných genů
- translokace = přemístění struktur genu do regulační sféry silného promotoru
- inzerce promotorů = zvýší expresi genů
- dále i přestavby na úrovni DNA (delece, inzerce); ovlivnění sestřihu
- regulace transkripce
- RNA-polymerasa – I
- v jadérku – transkribuje prekurzor rRNA (15 proteinů)
- RNA-polymerasa – II
- transkribuje všechny pre-mRNA (14 proteinů)
- RNA-polymerasa – III
- transkribuje všechny pre-tRNA (17 proteinů)
- regulace transkripce cis-elementy
- enhancery (zesilovače) / silencery (zeslabovače)
- enhancer se vytvořením kličky DNA přiblíží k promotoru, na který se naváží specifické proteiny – aktivátory
- tato vazba brání napojení RNA-polymerasy na promotor
- teprve po změně konformace komplexu působením signálních molekul nebo navázáním koaktivátorů je promotor uvolněn pro polymerasu a dojde k zahájení transkripce
- Transkripční faktory
- Zinc-fingers = proteiny, jejichž řetězce vytvářejí krátké smyčky, kde je atom Zn2+ vázán na 2 cysteiny a 2 histaminy; regulace transkripce 5S rRNA
- Leucinové zipy = spojují 2 α-helixy vazbami mezi molekulami leucinu
- HLH (helix – loop – helix)
- HTH (helix – turn – helix)
- Homeodomény
- regulace transkripce mediátory = signální molekuly
- koordinační činnost:
- parakrinní
- autokrinní
- endokrinní (hormony)
- koordinační činnost:
- RNA-polymerasa – I
- regulační genová kaskáda
- primárně regulované geny mohou přes svůj vlastní produkt následně regulovat i expresi dalších genů
- celá regulační kaskáda může mít celou řadu mezistupňů
- na konci regulační kaskády mohou vzniknout i takové faktory (produkty), které naopak utlumí aktivitu primárně regulovaných genů
- regulace úpravou pre-mRNA
- po transkripci pre-mRNA a navázání 5´ čepičky v průběhu transkripce
- úprava pre-mRNA:
- odštěpením 3´ konce a připojení poly(A)
- sestřih intronů a spojení exonů
- Další možnosti ovlivnění
- alternativní sestřih
- editace mRNA (změna struktury pre-mRNA)
- stabilita mRNA v cytoplazmě
- regulace na úrovni translace
- př. translace mRNA pro tvorbu ferritinu
- targeting
- genetická determinace nasměrování proteinů
Odkazy[upravit | editovat zdroj]
Související články[upravit | editovat zdroj]
Zdroj[upravit | editovat zdroj]
- ŠTEFÁNEK, Jiří. Medicína, nemoci, studium na 1. LF UK [online]. [cit. 2009]. <https://www.stefajir.cz/>.