Portál:Otázky z biochemie (1. LF UK, VL)

1. Typy chemických vazeb, slabé interakce

2. Voda a její fyzikální a chemické vlastnosti, význam v organismu

3. Disperzní soustavy, rozpustnost látek, pravé a koloidní roztoky, difuse, osmosa, osmotický a onkotický tlak, dialysa, příklady z biochemie

4. Energetika chemických reakcí, Gibbsova energie a entropie, aplikace na metabolické děje

5. Chemická rovnováha, Guldbergův-Waagův zákon. Kinetika a energetika následných a vratných reakcí, aplikace v enzymologii

6. Základní separačně detekční metodiky pro makromolekuly (elektroforéza, chromatografie, vysolování) a jejich využití v klinické praxi

7. Spektrofotometrie, princip a využití v klinické biochemii

8. Elektrolytická disociace, disociační konstanta, silné a slabé elektrolyty, příklady z biochemie

9. Brönstedova teorie kyselin a zásad, rovnováha v protolytických reakcích, příklady z biochemie. Iontový součin vody, pH a jeho význam v medicíně

10. Amfolyty, jejich vlastnosti, příklady z biochemie

11. Pufry, výpočet pH, význam v organismu

12. oxidace a redukce, oxidoredukční potenciál, závislost na koncentraci reaktantu a na pH, příklady z biochemie

13. Srážecí reakce, součin rozpustnosti, tvorba komplexu, příklady a jejich význam v biochemii a medicíně

14. Chemické vlastnosti hlavních biogenních prvků

15. Kyslík a jeho anorganické sloučeniny, reaktivita, vlastnosti. Peroxidace lipidů

16. Toxikologicky významné prvky, mechanismus působení vybraných toxických sloučenin (CO, KCN, HCN, H₂S, těžké kovy)

17. Biologický a metabolický význam stopových prvků

18. Koordinační sloučeniny

19. Struktura organických sloučenin, izomerie, příklady z metabolických drah

20. Halogen- a nitroderiváty uhlovodíků, příklady toxikologicky a lékařsky významných sloučenin

21. Sirné deriváty uhlovodíků, příklady lékařsky významných sloučenin

22. Aminy, význam v biochemii

23. Alkoholy, fenoly, aldehydy a ketony, uplatnění v metabolismu. Látky používané jako dezinfekční prostředky, mechanismus jejich účinku.

24. Karboxylové kyseliny, funkční a substituční deriváty karboxylových kyselin, uplatnění v biochemii

25. Dusíkaté, kyslíkaté a sirné heterocykly, význam

26. Strukturní charakteristiky aminokyselin, dělení, reakce, význam, peptidy, peptidová vazba, příklady biologicky významných peptidů

27. Bílkoviny, struktura, vlastnosti a funkce

28. Sacharidy, rozdělení, struktura, stereochemie, biologický význam

29. Reakce a deriváty monosacharidů, disacharidy, O- a N- glykosidová vazba, příklady

30. Homopolysacharidy a heteropolysacharidy, struktura, výskyt a význam v organismu

31. Proteoglykany, glykoproteiny, struktura, vlastnosti, příklady

32. Lipidy - klasifikace, struktura, vlastnosti, funkce v organismu. Mastné kyseliny

33. Fosfolipidy a sfingolipidy, struktura, vlastnosti a význam]]

34. Steroly, žlučové kyseliny a steroidní hormony, struktura, funkce a význam v organismu

    II. Základy metabolismu

35. Struktura enzymu (kofaktory, koenzymy, oligomerní struktura); mnohočetné enzymové formy a isoenzymy. Využití enzymologie v medicíně

36. Enzymová aktivita, fyzikálně chemické vlivy, regulace (exprese, allosterické vlivy, kovalentní modifikace). Enzymová aktivita a její měření

37. Dýchací řetězec. Oxidativní fosforylace.

38. Tzv. „makroergní“ sloučeniny, fosforylace na substrátové úrovni, pohon endergonních reakcí

39. Citrátový cyklus, amfibolický charakter, průběh, regulace

40. Obecné mechanismy přeměny aminokyselin, deaminace, transaminace, dusíková bilance

41. Koenzymy oxidoredukčních, karboxylačních a dekarboxylačních reakcí

42. Tvorba amoniaku, jeho detoxikace, ureosyntetický cyklus a jeho regulace, hyperamonémie

43. Metabolismus aminokyselin skupiny pyruvátu a oxalacetátu, zapojení těchto aminokyselin do metabolických procesů

44. Metabolismus uhlíkového skeletu aminokyselin skupiny 2-oxoglutarátu, sukcinyl-CoA , s rozvětveným řetězcem, zapojení aminokyselin do metabolických procesů

45. Metabolismus aromatických aminokyselin, poruchy

46. Metabolismus sirných aminokyselin

47. Biosyntéza, biodegradace a funkce nejdůležitějších biogenních aminů

48. Konverze aminokyselin do specializovaných produktů. Kreatin. S-adenosylmethionin

49. Glykolýza, regulace

50. Glukoneogeneze, regulace

51. Syntéza a degradace glykogenu, regulace, poruchy

52. Pentózový cyklus, regulace

53. Metabolismus galaktózy, poruchy, Metabolismus fruktózy, poruchy

54. Metabolismus kyseliny glukuronové a její význam v organismu

55. Biosyntéza mastných kyselin

56. Tvorba ketolátek z acetyl-CoA, metabolické příčiny, význam

57. Oxidace mastných kyselin, energetický výtěžek, karnitinový systém

58. Triacylglyceroly, biosyntéza, degradace

59. Biosyntéza a odbourávání fosfolipidů a sfingolipidů

60. Syntéza a degradace eikosanoidů, cyklooxygenázová a lipoxygenázová cesta

61. Biosyntéza cholesterolu a její regulace, úloha HMG-CoA reduktázy, transport endogenního a exogenního cholesterolu

62. Přeměna a vylučování cholesterolu, žlučové kyseliny

63. Biosyntéza a degradace steroidních hormonů

64. Transport lipidů, úlohy lipoproteinů, struktura lipoproteinové částice (vznik, přeměna a úloha chylomiker, VLDL, LDL a HDL lipoproteinů). Elektroforéza lipoproteinů

65. Biosyntéza a degradace tetrapyrrolů - hemu, poruchy biosyntézy, poruchy degradace

66. Významné proteiny krevní plazmy, význam v organismu (albumin, Ig, komplement, proteiny akutní fáze, transportní proteiny)

67. Metabolismus pyrimidinových nukleotidů, regulace, inhibitory, poruchy

68. Metabolismus purinových nukleotidů, regulace, inhibitory, poruchy

    III. Základy biochemie orgánu a funkcí

69. Regulace a koordinace metabolismu sacharidů a ostatních živin

70. Glykémie, regulace, diagnostika (oGTT, glykovaný hemoglobin)

71. Metabolismus tukové tkáně

72. Regulace biosyntézy hemu, rozdíly mezi hepatocytem a erythroidní buňkou, metabolismus železa

73. Hormonální regulace vodního a minerálního metabolismu

74. Hormonální regulace energetického metabolismu

75. Biochemické pochody při trávení živin

76. Biochemické funkce hepatocytu a jater, možnosti biochemické diagnostiky poškození hepatocytu a jaterních funkcí

77. Biotransformace endogenních a exogenních látek, typy biotransformačních procesů, toxické a kancerogenní látky v životním prostředí

78. Pufrové systémy organismu, funkce a význam pro acidobazickou rovnováhu

79. Metabolismus erytrocytů

80. Hemokoagulace, kaskáda koagulačních faktorů, úloha trombocytu

81. Moč – fyziologické a patologické součásti.

82. Kolagen – struktura, vlastnosti, metabolismus.

83. Biochemie pojiva (chrupavka, kost)

84. Biochemie kůže. Biochemický výklad hmatu.

85. Kontraktilní aparát, řízení kontrakce hladké a kosterní svaloviny

86. Markery poškození svalové tkáně, význam, stanovení

87. Biochemie vidění, Waldův cyklus, transducinový cyklus

88. Biochemie smyslů (sluch, chuť, čich)

89. Biochemie nervových synapsí; neurotransmitery.

90. Katecholaminy - biosynthesa, biodegradace

91. Steroidní hormony

92. Peptidové hormony a jejich funkce v endokrinních regulačních dějích

93. Lokální mediátory, cytokiny

94. Hormony štítné žlázy a jejich funkce v regulačních dějích

95. Molekulární základy humorální imunitní odpovědi – Struktura a funkce jednotlivých částí imunoglobulinů, třídy imunoglobulinů. Molekulární podstata diverzity imunoglobulinů

96. Molekulární základy buněčné imunity – Rozpoznání patogenu, efektorové mechanismy, MHC molekuly, struktura a funkce, mechanismus prezentace antigenů T_C a T_H lymfocytům.

97. Základní imunochemické metody. Imunoturbidimetrie, ELISA, RIA

98. Vitaminy rozpustné v tucích

99. Vitaminy rozpustné ve vodě

100. Struktura, složení a vlastnosti buněčných membrán

101. Transport látek přes membrány

102. Kompartmentace biochemických procesů na úrovni buňky

     IV. Základy buněčné a molekulární biologie

103. Základní principy buněčné signalizace

104. Membránové receptory a jejich ligandy, G-proteiny

105. Typy a úloha druhých poslů v přenosu signálu

106. Signálně transdukční kaskády cytokinů a růstových faktorů

107. Aktivace fosfolipas a signalizace využívající deriváty lipidů

108. Signalizace NO, Přehled signálních cest a význam

109. Intracelulární receptory a jejich ligandy, heat-shock protein, interakce intracelulárních receptorů s DNA

110. Amplifikace, integrace a vzájemná komunikace („cross-talk“) signálních drah

111. Struktura nukleových kyselin

112. Organizace prokaryontního, eukaryontního a mitochondriálního genomu

113. Struktura lidského genomu. Techniky sekvenování DNA. Projekty sekvenování lidského genomu

114. Replikace eukaryontní DNA, replikační aparát a jeho regulace

115. Reparace DNA

116. Transkripce eukaryontní genomové DNA Struktura mRNA, posttranskripční úpravy. Metabolismus RNA. Transkripční faktory, vazba DNA-protein

117. Metabolismus RNA a RNA interference

118. Regulace genové exprese na úrovni transkripce

119. Genetický kód a jeho vlastnosti

120. Eukaryontní, prokaryontní a mitochondriální translace a její regulace

121. Regulace translace

122. Posttranslační úpravy proteinu.Třídění a transport proteinu, úpravy a třídění proteinu v Golgiho aparátu. Biosyntéza glykoproteinů

123. Vezikulární transport. Endocytóza a exocytóza

124. Restrikční enzymy a jejich využití, úpravy DNA a konstrukce rekombinantních molekul. Klonování DNA

125. DNA diagnostika, techniky (RFLP, hybridizace)

126. Metody frakcionace buňky, elektroforéza nukleových kyselin a proteinu

127. Polymerasová řetězová reakce, uplatnění PCR v klinické diagnostice, RT-PCR a využití této techniky, techniky sekvenování DNA

128. Povaha genových mutací, mutace dědičné a získané, polymorfismy, mini- a mikrosatelitové markery, metody detekce

129. DNA a RNA viry, replikace

130. Úloha protoonkogenu a tumor supresorových genů

131. Buněčný cyklus, úloha komplexu cyklinu a cdks

132. Regulace buněčného cyklu, úloha tumor supresorových genů

133. Ubikvitinace a proteasomální degradace proteinu

134. Biochemie apoptosy

135. Epigenetika a její význam, Modifikace histonů, Metylace DNA, význam