Uživatel:David.Mirth/Kniha

I. Základy fyzikální, anorganické a organické chemie

1. Typy chemických vazeb

   slabé interakce

2. Voda a její fyzikální a chemické vlastnosti

   Význam vody v organismu.

3. Disperzní soustavy

   , rozpustnost látek, pravé a

   koloidní roztoky

   .

4. Difuze

   ,

   osmóza

   ,

   osmotický

   a

   onkotický tlak

   ,

   dialýza

   , příklady z biochemie.

5. Energetika chemických reakcí,

   Gibbsova energie

   a

   entropie

   , aplikace na metabolické děje.

6. Chemická rovnováha

   , Guldbergův-Waagův zákon.

   Kinetika

   a energetika následných a vratných reakcí, aplikace v enzymologii.

7. Základní metody pro separaci makromolekul (

   elektroforéza

   ,

   chromatografie

   , vysolování) a jejich využití v klinické praxi.

8. Spektrofotometrie

   , princip a využití v klinické biochemii.

9. Elektrolytická disociace,

   disociační konstanta

   , silné a slabé elektrolyty, příklady z biochemie.

10. Brönstedova teorie kyselin a zásad

    ,

    rovnováha v protolytických reakcích

    , příklady z biochemie.

11. Iontový součin vody,

    pH

    a jeho význam v medicíně.

12. Amfolyty

    , jejich vlastnosti, příklady z biochemie.

13. Pufry

    , výpočet

    pH

    , význam v organismu.

14. Oxidace a redukce,

    oxidoredukční potenciál

    , závislost na koncentraci reaktantů, příklady z biochemie.

15. Srážecí reakce,

    součin rozpustnosti

    , tvorba komplexu,

    koordinační sloučeniny

    , příklady a jejich význam v biochemii a medicíně.

16. Chemické vlastnosti hlavních biogenních prvků

    .

17. Kyslík

    a jeho anorganické sloučeniny, reaktivita, vlastnosti.

18. Peroxidace lipidů

    .

19. Toxikologicky významné prvky, mechanismus působení vybraných toxických sloučenin (

    CO

    , KCN,

    HCN

    , H₂S,

    těžké kovy

    ).

20. Biologický a metabolický význam stopových prvků

    .

21. Struktura organických sloučenin, izomerie, příklady z metabolických drah.

22. Halogen- a nitroderiváty uhlovodíků, příklady toxikologicky a lékařsky významných sloučenin.

23. Sirné deriváty uhlovodíků, příklady lékařsky významných sloučenin.

24. Aminy

    , význam v biochemii.

25. Alkoholy

    ,

    fenoly

    ,

    aldehydy a ketony

    , uplatnění v metabolismu.

    Látky používané jako dezinfekční prostředky, mechanismus jejich účinku

    .

26. Karboxylové kyseliny

    , funkční a substituční deriváty karboxylových kyselin, uplatnění v biochemii.

27. Dusíkaté, kyslíkaté a sirné heterocykly, význam.

28. Strukturní charakteristiky

    aminokyselin

    , dělení, reakce, význam.

29. Peptidy

    , peptidová vazba, příklady biologicky významných peptidů.

30. Bílkoviny

    , struktura, vlastnosti a funkce.

31. Sacharidy

    , rozdělení, struktura, stereochemie, biologický význam.

32. Reakce a deriváty monosacharidů, disacharidy, O- a N- glykosidová vazba, příklady

    .

33. Homopolysacharidy a heteropolysacharidy, struktura, výskyt a význam v organismu

    .

34. Proteoglykany

    ,

    glykoproteiny

    , struktura, vlastnosti, příklady.

35. Lipidy

    - klasifikace, struktura, vlastnosti, funkce v organismu.

36. Mastné kyseliny

    .

37. Fosfolipidy

    a

    sfingolipidy

    , struktura, vlastnosti a význam.

38. Steroly,

    žlučové kyseliny

    a

    steroidní hormony

    , struktura, funkce a význam v organismu.

II. Základy metabolismu

1. Struktura enzymů

   (jednoduché a složené; apoenzyma holoenzym; kofaktory; koenzymy; prosthetickéskupiny; koaktivátory; oligomerní struktura); mnohočetné enzymové formy a

   isoenzymy

   . Klasifikace enzymů. Příklady, význam.

2. Enzymová aktivita a její měření

   , fyzikálně chemické faktory ovlivňující aktivitu enzymů, regulace enzymů (exprese, kovalentní modifikace, allosterické vlivy). Využití enzymologie v medicíně.

3. Energetika enzymové katalýzy. Kinetika monomerních a oligomerních enzymů, příklady. Km, kcat, katalyická účinnost enzymu.

4. Inhibice enzymů: kompetetivní, nekompetetivní, kovalentní, allosterická. Využití enzymových inhibitorů v medicíně.

5. Dýchací řetězec

   .

   Oxidativní fosforylace

   .

6. Tzv. makroergní sloučeniny, fosforylace na substrátové úrovni, pohon endergonních reakcí.

7. Citrátový cyklus

   , amfibolický charakter, průběh, regulace.

8. Obecné mechanismy přeměny aminokyselin, deaminace, transaminace

   ,

   dusíková bilance

   .

9. Koenzymy oxidoredukčních, karboxylačních a dekarboxylačních reakcí

   .

10. Tvorba amoniaku, jeho detoxikace,

    ureosyntetický cyklus a jeho regulace

    ,

    hyperamonémie

    .

11. Metabolismus aminokyselin skupiny pyruvátu a oxalacetátu

    , zapojení těchto aminokyselin do metabolických procesů.

12. Metabolismus uhlíkového skeletu aminokyselin skupiny 2-oxoglutarátu, sukcinyl-CoA , s rozvětveným řetězcem, zapojení aminokyselin do metabolických

    procesů.

13. Metabolismus aromatických aminokyselin

    ,

    poruchy

    .

14. Metabolismus sirných aminokyselin.

15. Biosyntéza, biodegradace a funkce

    nejdůležitějších biogenních aminů

    .

16. Konverze aminokyselin do specializovaných produktů: kreatin, S-adenosylmethionin, karnitin, taurin a jejich význam.

17. Glykolýza

    , regulace, oxidace pyruvátu, pyruvátdehydrogenázový komplex.

18. Glukoneogeneze

    , regulace.

19. Syntéza a degradace glykogenu

    , regulace.

20. Pentózový cyklus

    , regulace.

21. Metabolismus galaktózy

    ,

    poruchy

    .

    Metabolismus fruktózy

    ,

    poruchy

    .

22. Metabolismus kyseliny glukuronové a její význam v organismu

    .

23. Biosyntéza mastných kyselin

    .

24. Tvorba

    ketolátek

    z acetyl-CoA, metabolické příčiny, význam.

25. Oxidace mastných kyselin, energetický výtěžek

    ,

    karnitinový systém

    .

26. Triacylglyceroly

    , biosyntéza, degradace.

27. Biosyntéza a odbourávání fosfolipidů (glycerofosfolipidů a sfingolipidů).

28. Biosyntéza prostaglandinů, thromboxanů a leukotrienů.

29. Biosyntéza

    cholesterol

    u a její regulace, úloha HMG-CoA reduktázy a SREBP proteinu.

30. Přeměna a vylučování cholesterolu,

    biosyntéza žlučových kyselin

    a její regulace.

31. Biosyntéza a degradace steroidních hormonů.

32. Transport lipidů, úlohy lipoproteinů,

    struktura lipoproteinové částice

    .

    Elektroforéza lipoproteinů

    .

33. Transport endogenního a exogenního cholesterolu (vznik, přeměna a úloha chylomiker, VLDL, LDL a HDL lipoproteinů).

34. Biosyntéza

    tetrapyrrolů

    –

    hemu

    a její poruchy.

35. Degradace

    tetrapyrrolů

    –

    hemu

    a její poruchy.

36. Metabolismus pyrimidinových nukleotidů

    , regulace, inhibitory, poruchy.

37. Metabolismus purinových nukleotidů

    , regulace, inhibitory, poruchy.

38. Reaktivní formy kyslíku, vznik a význam, antioxidanty.

III. Základy biochemie orgánů a funkcí

1. Vzájemné biochemické vztahy metabolismu sacharidů a ostatních živin.

2. Glykemie

   , regulace, diagnostika (

   oGTT

   ,

   glykovaný hemoglobin

   ).

3. Metabolismus tukové tkáně.

4. Regulace biosyntézy hemu, rozdíly mezi hepatocytem a erythroidní buňkou,

   metabolismus železa

   .

5. Mechanismus účinku hormonů regulujících vodní a minerální metabolismus.

6. Hormonální regulace energetického metabolismu.

7. Biochemické pochody při

   trávení

   živin.

8. Biochemické funkce hepatocytu a jater

   ,

   možnosti biochemické diagnostiky poškození hepatocytu a jaterních funkcí

   .

9. Biotransformace

   endogenních a exogenních látek, typy biotransformačních procesu, toxické a kancerogenní látky v životním prostředí.

10. Pufrové systémy organismu

    , funkce a význam pro

    acidobazickou rovnováhu

    .

11. Metabolismus erytrocytů

    .

12. Významné proteiny krevní plazmy

    , význam v organismu (

    albumin

    ,

    Ig

    ,

    proteiny akutní fáze

    , transportní proteiny).

13. Hemokoagulace, kaskáda koagulačních faktorů

    , úloha trombocytů.

14. Fibrin, fibrinolýza. Mechanismus účinku antikoagulačních látek.

15. Moč

    – fyziologické a patologické součásti.

16. Extracelulární matrix, extracelulární polysacharidy a proteiny (

    kolagen

    , elastin) - struktura, vlastnosti, funkce. Metabolismus kolagenu.

17. Biochemie pojiva (chrupavka, kost).

18. Biochemie kůže (bariérová funkce, vitamin D, cytokeratiny, mezibuněčná spojení, biosyntéza melaninů).

19. Kontraktilní aparát, řízení kontrakce hladké a kosterní svaloviny.

20. Markery poškození svalové tkáně, význam, stanovení

    .

21. Biochemie vidění

    , Waldův cyklus, transducinový cyklus.

22. Biochemie smyslů (chuť, čich).

23. Biochemie nervových

    synapsí

    neurotransmitery

    .

24. Katecholaminy - biosyntéza, biodegradace

    .

25. Steroidní hormony

    - struktura receptorů pro steroidní hormony, mechanismu účinku, funkce.

26. Peptidové hormony - mechanismy účinku, funkce.

27. Lokální mediátory (

    cytokiny

    , růstové faktory, chemokiny) - funkce, mechanismu účinku.

28. Hormony štítné žlázy a jejich funkce v regulačních dějích

    .

29. Struktura a funkce jednotlivých částí imunoglobulinů. Třídy imunoglobulinů, vlastnosti a funkce

    . Monoklonální protilátky - příprava a využití.

30. Molekulární podstata diverzity imunoglobulinů primární a sekundární protilátkové odpovědi, somatická rekombinace, izotypový přesmyk.

31. Molekulární základy buněčné imunity - rozpoznání patogenu, efektorové mechanismy. MHC molekuly - struktura, funkce, mechanismy prezentace antigenů Tc a Th lymfocytům.

32. Základní imunochemické metody

    . Imunoturbidimetrie,

    ELISA

    ,

    RIA

    .

33. Vitamíny rozpustné v tucích

    .

34. Vitamíny rozpustné ve vodě

    .

35. Struktura, složení a vlastnosti buněčných membrán

    .

36. Transport látek přes membrány

    .

37. Cytoskelet

    .

38. Kompartmentace biochemických procesů na subcelulární úrovni

    .

IV. Základy buněčné a molekulární biologie

1. Principy, mechanismy a význam mezibuněčné komunikace a intracelulárních signálně-transdukčních kaskád.

2. Druhy membránových receptorů a jejich ligandy

   , biologický význam, příklady.

3. Jaderné receptory, heat-shock proteiny, interakce jaderných receptorů s DNA.

4. Amplifikace, integrace a vzájemná komunikace („cross-talk“) signálních drah.

5. G-proteiny - struktura, aktivace, funkce

   .

6. Typy a úloha druhých poslů v přenosu signálu

   .

7. Mechanismus a význam reverzibilní fosforylace v signální transdukci.

8. Signalizace stimulovaná růstovými faktory (MAPK, PKB/AKT) a cytokiny (JAK-STAT).

9. Signální dráhy závislé na proteolýze, příklady. Signální úloha HIF v odpovědi na hypoxii.

10. Signalizace využívající NO

    , medicínský význam.

11. Struktura a funkce DNA.

12. Struktura a funkce RNA.

13. Organizace prokaryontního, eukaryontního a

    mitochondriálního genomu

    .

14. Techniky sekvenování DNA

    (Sanger, NGS, sekvenování lidského genomu).

15. Klasifikace lidské genomové DNA podle repetitivnosti a funkce, pseudogeny, transpozony.

16. Replikace

    eukaryontní DNA, replikační aparát a jeho regulace.

17. Reparace DNA

    - BER, NER, MMR, přímá reparace modifikovaných bází.

18. Reparace DNA

    - HR, NHEJ.

19. Transkripce

    prokaryontní a eukaryontní genomové DNA. Transkripční faktory, vazba DNA-protein.

20. Struktura mRNA, posttranskripční úpravy (cap, poly A, splicing).

21. RNA interference, druhy a funkce nekódujících RNA.

22. Regulace genové exprese na úrovni transkripce.

23. Genetický kód

    a jeho vlastnosti.

24. Eukaryontní

    a

    prokaryontní

    translace. Regulace translace.

25. Třídění, transport a posttranslační úpravy proteinů

    .

26. Biosyntéza glykoproteinů

    a jejich význam.

27. Vezikulární transport.

    Endocytóza

    a

    exocytóza

    .

28. Restrikční enzymy

    a další nástroje genového inženýrství, konstrukce rekombinantních molekul DNA a proteinů. Klonování DNA.

29. Metody frakcionace buňky,

    elektroforéza nukleových kyselin

    a

    proteinů

    .

30. Polymerázová řetězová reakce

    , uplatnění PCR v klinické diagnostice, RT-PCR a využití této techniky.

31. Povaha

    genových mutací

    , mutace dědičné a získané,

    polymorfismy

    , mini- a mikrosatelitové sekvence a jejich využití.

32. DNA

    a

    RNA viry

    - struktura a replikace.

33. Protoonkogeny

    .

34. Tumor supresorové geny

    .

35. Buněčný cyklus

    , úloha komplexu cyklinů a cdks (cyklin dependentní kinázy).

36. Ubikvitinace a proteazomová degradace proteinů

    , příklady.

37. Biochemie

    apoptózy

    , příklady pro- a antiapoptotických genů/proteinů. Kaspázy. Úloha mitochondrií v buněčné smrti.

38. Epigenetika

    ,

    modifikace histonů

    ,

    metylace DNA

    , význam.