Portál:R wiki

Portál R wiki je věnován programovacímu jazyku R a jeho užití v biomedicíně. Důraz zde klademe na jednoduché a postupné seznamování s jazykem od úplných základů. Pokročilejším uživatelům je určena rozšířená a podrobnější verze portálu, kde lze najít další zdroje ke studiu.

Úvod

R je programovací jazyk, obecněji prostředí, vhodný zejména pro statistické výpočty a jejich grafické výstupy. Možnosti jeho použití jsou však mnohem širší. Je to svobodný software uvolněný pod licencí GNU a o jeho rozvoj se stará početná komunita.

• Úvod:
  • Proč bych se měl právě já učit R
• Co potřebuji pro začátek:
  • Nainstalovat jazyk R do počítače
• Aplikace, kde můžu pohodlně programovat:
  • RStudio (zdarma, volitelné – teoreticky stačí prostředí R nainstalované výše)
  • Základy práce v RStudiu (užitečný základ R i pro uživatele, kteří si RStudio nenainstalují a budou používat jednoduchou konzoli R)
  • R commander (další grafické uživatelské rozhraní pro jazyk R)
• Co se může taky hodit:
  • Pandoc („švýcarský armádní nůž“ pro převod dokumentů mezi značkovacími jazyky, mimo jiné i wiki)
  • MiKTex (program usnadňující tvorbu dokumentů v TeX/LaTex)
  • Notepad++ (textový editor)

Základy jazyka R

•  Úvodní lekce
  • Základy jazyka R (výpis textu na obrazovku, základní aritmetické operace, komentáře, nastavení pracovní složky)
• Základní stavební prvky jazyka R
  • Datové typy (numerická hodnota, celé číslo, komplexní číslo, logická hodnota, textový řetězec, NA, NULL, NaN)
  • Datové struktury (vektor, faktor, matice, pole, tabulky dat, seznam)
• Matematika nad datovými strukturami
  • Matematické operace
• Základy programování v R
  • Podmínky a cykly
  • Funkce
• Tvorba grafických výstupů
  • Diagramy v R
  • R Markdown
  • Shiny aplikace

Základy statistiky v R

Cílem této sekce je poskytnout základní kuchařku (cookbook) použití jazyka R ve statistických výpočtech.

• Popisná statistika v R
• Explorační analýza dat v R
• Pravděpodobnost v R

Příklady a tutoriály

•  Pro začátečníky
  • Základy
  • Vektory
  • Matice
  • Faktory
  • Datové tabulky
  • Seznamy
• Pro pokročilé
  • Import a export dat
  • Export dat do MS Excelu
  • Matice - příklad č.1
  • Matice - příklad č.2

Externí odkazy

• R Tutorial na webu w3schools.com
• Seminář Lubomíra Štěpánka „Úvod do jazyka R“
• Volitelný předmět Úvod do skriptovacího jazyka R (v SISu pod kódem B03128)
• Tutoriály na Datacamp
• Web R Markdownu
• E-learningová učebnice Matematická biologie (analýza dat, statistika, R, modelování)
  • Základy R pro biology
• R Bootcamp webový kurz na téma Tidyverse