Mutace: Porovnání verzí
Feedback

Z WikiSkript

m (Editace uživatele „Klárka“ (diskuse) vráceny do předchozího stavu, jehož autorem je „HypoBOT“)
m (Zrušena verze 415027 od uživatele Klárka (diskuse) omylem vrácené editace)
Řádek 2: Řádek 2:
[[Soubor:DNA UV mutation.svg|náhled|Poškození molekuly [[DNA (nukleová kyselina)|DNA]] UV zářením]]
[[Soubor:DNA UV mutation.svg|náhled|Poškození molekuly [[DNA (nukleová kyselina)|DNA]] UV zářením]]
'''Mutace''' je '''změna genetické informace'''. Způsobují ji různé vlivy – nejčastěji se za mutageny považují:
'''Mutace''' je '''změna genetické informace'''. Způsobují ji různé vlivy – nejčastěji se za mutageny považují:
* '''fyzikální faktory''' (UV a ionizující záření);
* '''fyzikální faktory''' ([[Ultrafialové záření (biofyzika)|UV]] a [[ionizující záření]]);
* '''chemické faktory''' (např. planární aromatické sloučeniny, silná oxidans, radikálové iniciátory);
* '''chemické faktory''' (např. planární aromatické sloučeniny, silná oxidans, radikálové iniciátory);
* '''biologické faktory''' (virové infekce atp.).
* '''biologické faktory''' ([[Virové infekce nervového systému|virové infekce]] atp.).


Jedná se o náhodný proces, ale zároveň bylo prokázáno, že v některých oblastech [[genom]]u k mutacím dochází častěji a jsou označované jako '''hot-spots'''.
Jedná se o náhodný proces, ale zároveň bylo prokázáno, že v některých oblastech [[genom]]u k mutacím dochází častěji a jsou označované jako '''hot-spots'''.
Řádek 10: Řádek 10:
Mutace, pokud se projeví (viz níže), může způsobit vážné onemocnění, ať už různé [[vrozené vady]] nebo [[Nádory|neoplazie]]. Je ovšem zároveň považována za jeden z mechanismů [[evoluce]].
Mutace, pokud se projeví (viz níže), může způsobit vážné onemocnění, ať už různé [[vrozené vady]] nebo [[Nádory|neoplazie]]. Je ovšem zároveň považována za jeden z mechanismů [[evoluce]].


Vzniku mutací zabraňují [[reparační procesy DNA]], případně tzv. '''zpětné mutace'''. Ke zvýšené incidenci mutací dochází při defektu v genech kódujících reparační enzymy (mutátorové geny), což je podkladem různých chorob (např. [[Fanconiho anémie|Fanconiho pancytopenie]], [[xeroderma pigmentosum]], [[Cockaynův syndrom]]).
Vzniku mutací zabraňují [[reparační procesy DNA]], případně tzv. '''zpětné mutace'''. Ke zvýšené incidenci mutací dochází při defektu v [[gen|genech]] kódujících reparační enzymy (mutátorové geny), což je podkladem různých chorob (např. [[Fanconiho anémie|Fanconiho pancytopenie]], [[xeroderma pigmentosum]], [[Cockaynův syndrom]]).


== Rozdělení mutací ==
== Rozdělení mutací ==
Podle buněčné linie, která je mutací postižena:
Podle buněčné linie, která je mutací postižena:
* '''somatické mutace''' — v případě, že se projeví, jsou příčinou špatně fungující buňky, což může vést až ke spuštění procesu [[apoptóza|apoptózy]], případně vzniku neoplázie;
* '''somatické mutace''' — v případě, že se projeví, jsou příčinou špatně fungující buňky, což může vést až ke spuštění procesu [[apoptóza|apoptózy]], případně vzniku neoplázie;
* '''mutace zárodečných buněk''' — v případě, že se projeví, mohou způsobit spontánní potrat nebo [[vrozené vývojové vady|vrozené vady]].
* '''mutace zárodečných buněk''' — v případě, že se projeví, mohou způsobit [[potrat|spontánní potrat]] nebo [[vrozené vývojové vady|vrozené vady]].


Podle oblasti genomu a projevu:
Podle oblasti genomu a projevu:
* '''kódující oblasti''' — většinou způsobí patologii, podle toho, k jaké změně došlo (viz níže);
* '''kódující oblasti''' — většinou způsobí patologii, podle toho, k jaké změně došlo (viz níže);
* '''nekódující oblasti''' — většinou se neprojeví a jedná se o tzv. '''tiché''' mutace, pokud ke změně nedošlo v následujících nekódujících oblastech:
* '''nekódující oblasti''' — většinou se neprojeví a jedná se o tzv. '''tiché''' mutace, pokud ke změně nedošlo v následujících nekódujících oblastech:
:* [[promotor]]y, [[Transkripce|enhancery]] a [[silencer]]y — ovlivňují expresi genu; nesprávná exprese [[(Proto)onkogeny|protoonkogenů]] a [[Tumor supresorové geny|onkosupresorových genů]] je pak příčinou nádorového bujení;
:* [[promotor]]y, [[Transkripce|enhancery]] a silencery — ovlivňují expresi genu; nesprávná exprese [[(Proto)onkogeny|protoonkogenů]] a [[Tumor supresorové geny|onkosupresorových genů]] je pak příčinou [[Charakteristika nádorového bujení|nádorového bujení]];
:* [[introny]] — může docházet k tzv. exonizaci intronu a pak se jedná o '''sestřihové''' mutace; speciálně se vyčleňují.
:* [[introny]] — může docházet k tzv. exonizaci intronu a pak se jedná o '''sestřihové''' mutace; speciálně se vyčleňují.
* '''kryptické''' mutace — v oblastech velmi podobných místům sestřihu.
* '''kryptické''' mutace — v oblastech velmi podobných místům sestřihu.
Řádek 29: Řádek 29:
:* ''inzerci'' (taktéž),
:* ''inzerci'' (taktéž),
:* ''substituci'':
:* ''substituci'':
:*# '''tranzice''' — změna [[purin]]u na purin nebo [[pyrimidin]]u na pyrimidin (C → T, T → C, A → G, G → A);
:*# '''tranzice''' — změna purinu na purin nebo [[pyrimidin]]u na pyrimidin (C → T, T → C, A → G, G → A);
:*# '''transverze''' — změna purinu na pyrimidin nebo naopak (A → T, T → A, C → A, A → C, G → T, T → G, G → C, C → G).
:*# '''transverze''' — změna purinu na pyrimidin nebo naopak (A → T, T → A, C → A, A → C, G → T, T → G, G → C, C → G).
::* projevy se odvíjejí od toho, jestli [[Genetický kód|kodon]] se zaměněnou bází kóduje [[aminokyselina|aminokyselinu]] stejnou, jinou, nebo žádnou:
::* projevy se odvíjejí od toho, jestli [[Genetický kód|kodon]] se zaměněnou bází kóduje [[aminokyselina|aminokyselinu]] stejnou, jinou, nebo žádnou:
Řádek 57: Řádek 57:


* mutace rozsáhlejších oblastí:
* mutace rozsáhlejších oblastí:
** '''delece''' — způsobí, že bude ve výsledném proteinu méně aminokyselin. Zároveň, pokud počet deletovaných nukleotidů '''není násobek tří''', dochází k '''frameshiftu''' – s velkou pravděpodobností se v blízkém okolí vyskytne nově vzniklý stop [[Kodony (tabulka)|kodon]] a protein bude nejspíše nefunkční;
** '''delece''' — způsobí, že bude ve výsledném [[Bílkoviny (1. LF UK, NT)|proteinu]] méně aminokyselin. Zároveň, pokud počet deletovaných nukleotidů '''není násobek tří''', dochází k '''frameshiftu''' – s velkou pravděpodobností se v blízkém okolí vyskytne nově vzniklý stop [[Kodony (tabulka)|kodon]] a protein bude nejspíše nefunkční;
** '''inzerce''' — do výsledného proteinu se zařadí více aminokyselin, obdobně jako u delece může docházet k '''frameshiftu''';
** '''inzerce''' — do výsledného proteinu se zařadí více aminokyselin, obdobně jako u delece může docházet k '''frameshiftu''';
** '''jiné''' [[strukturní chromosomové aberace]].
** '''jiné''' [[strukturní chromosomové aberace]].

Verze z 4. 11. 2018, 21:21

Poškození molekuly DNA UV zářením

Mutace je změna genetické informace. Způsobují ji různé vlivy – nejčastěji se za mutageny považují:

  • fyzikální faktory (UV a ionizující záření);
  • chemické faktory (např. planární aromatické sloučeniny, silná oxidans, radikálové iniciátory);
  • biologické faktory (virové infekce atp.).

Jedná se o náhodný proces, ale zároveň bylo prokázáno, že v některých oblastech genomu k mutacím dochází častěji a jsou označované jako hot-spots.

Mutace, pokud se projeví (viz níže), může způsobit vážné onemocnění, ať už různé vrozené vady nebo neoplazie. Je ovšem zároveň považována za jeden z mechanismů evoluce.

Vzniku mutací zabraňují reparační procesy DNA, případně tzv. zpětné mutace. Ke zvýšené incidenci mutací dochází při defektu v genech kódujících reparační enzymy (mutátorové geny), což je podkladem různých chorob (např. Fanconiho pancytopenie, xeroderma pigmentosum, Cockaynův syndrom).

Rozdělení mutací

Podle buněčné linie, která je mutací postižena:

  • somatické mutace — v případě, že se projeví, jsou příčinou špatně fungující buňky, což může vést až ke spuštění procesu apoptózy, případně vzniku neoplázie;
  • mutace zárodečných buněk — v případě, že se projeví, mohou způsobit spontánní potrat nebo vrozené vady.

Podle oblasti genomu a projevu:

  • kódující oblasti — většinou způsobí patologii, podle toho, k jaké změně došlo (viz níže);
  • nekódující oblasti — většinou se neprojeví a jedná se o tzv. tiché mutace, pokud ke změně nedošlo v následujících nekódujících oblastech:
  • kryptické mutace — v oblastech velmi podobných místům sestřihu.
Druhy chromosomových mutací.

Podle změny genetické informace:

  • bodové mutace — změna v jednom nukleotidu: může se jednat o:
  • deleci (analogické mutacím rozsáhlejších oblastí),
  • inzerci (taktéž),
  • substituci:
    1. tranzice — změna purinu na purin nebo pyrimidinu na pyrimidin (C → T, T → C, A → G, G → A);
    2. transverze — změna purinu na pyrimidin nebo naopak (A → T, T → A, C → A, A → C, G → T, T → G, G → C, C → G).
  • projevy se odvíjejí od toho, jestli kodon se zaměněnou bází kóduje aminokyselinu stejnou, jinou, nebo žádnou:
  1. samesense (silent) — jedná se o tzv. tichou mutaci (je zařazena stejná aminokyselina);
  2. missense — zařadí se jiná aminokyselina a může tak být změněna až znemožněna funkce genového produktu;
  3. nonsense — substituce zapříčiní vznik nového stop kodonu a tím kratšího genového produktu, jenž bude pravděpodobně nefunkční.


K bodovým mutacím je nejnáchylnější cytosin, který snadno podléhá zejména spontánní deaminaci na uracil. Polymerázy jej pak chybně čtou jako T, takže dochází k tranzici C·G páru za T·A pár, a zapojení opravných mechanismů může vést i k jiným typům změn. Poločas cytosinu může být za určitých podmínek kolem 19 dní. Ostatní báze jsou mnohem stabilnější, jejich poločas se pohybuje kolem jednoho roku.[1]


  • mutace rozsáhlejších oblastí:
    • delece — způsobí, že bude ve výsledném proteinu méně aminokyselin. Zároveň, pokud počet deletovaných nukleotidů není násobek tří, dochází k frameshiftu – s velkou pravděpodobností se v blízkém okolí vyskytne nově vzniklý stop kodon a protein bude nejspíše nefunkční;
    • inzerce — do výsledného proteinu se zařadí více aminokyselin, obdobně jako u delece může docházet k frameshiftu;
    • jiné strukturní chromosomové aberace.
Příklady klinicky významných mutací


Odkazy

Související články

Použitá literatura

  • SOUKUPOVÁ, Milena a František SOUKUP. Kapitoly z lékařské biologie a genetiky II. 1. vydání. Praha : Karolinum, 1997. 86 s. s. 63 – 66. ISBN 80-7184-581-7.

Reference

  1. GAUDELLI, Nicole M., Alexis C. KOMOR a Holly A. REES. Programmable base editing of A•T to G•C in genomic DNA without DNA cleavage. Nature. 2017, roč. 7681, vol. 551, s. 464-471, ISSN 0028-0836. DOI: 10.1038/nature24644.