Mutace: Porovnání verzí
Feedback

Z WikiSkript

(založení článku)
 
m (Nový obrázek transverze a tranzice)
 
(Není zobrazeno 58 mezilehlých verzí od 24 dalších uživatelů.)
Řádek 1: Řádek 1:
mutace je změna genetické informace. Způsobují ji různé vlivy, nejčastěji se za mutageny považují '''fyzikální''' (UV a ionizující záření), '''chemické''' (např. planární aromatické sloučeniny, silná oxidans, radikálové iniciátory) a '''biologické faktory''' (virové infekce atp.).
__NOTOC__
[[Soubor:DNA UV mutation.svg|náhled|Poškození molekuly [[DNA (nukleová kyselina)|DNA]] UV zářením]]
'''Mutace''' je '''změna genetické informace'''. Způsobují ji různé vlivy nejčastěji se za mutageny považují:
* '''fyzikální faktory''' ([[Ultrafialové záření (biofyzika)|UV]] a [[ionizující záření]]);
* '''chemické faktory''' (např. planární aromatické sloučeniny, silná oxidans, radikálové iniciátory);
* '''biologické faktory''' ([[Virové infekce nervového systému|virové infekce]] atp.).


Jedná se o náhodný proces, ale zároveň bylo prokázáno, že v některých oblastech genomu k mutací dochází častěji a jsou označované jako '''hot-spots'''.
Jedná se o náhodný proces, ale zároveň bylo prokázáno, že v některých oblastech [[genom]]u k mutacím dochází častěji a jsou označované jako '''hot-spots'''.


Mutace, pokud se projeví (viz níže), může způsobit vážné onemocnění, ať už různé vrozené vady nebo neoplasie. Je ovšem zároveň považována za jeden z mechanismů evoluce.
Mutace, pokud se projeví (viz níže), může způsobit vážné onemocnění, ať už různé [[vrozené vady]] nebo [[Nádory|neoplazie]]. Je ovšem zároveň považována za jeden z mechanismů [[evoluce]].


Vzniku mutací zabraňují [[reparační procesy DNA]], případně tzv. '''zpětné mutace'''. Ke zvýšené incidenci mutací dochází při defektu v genech kódujících reparační enzymy (mutátorové geny), což je podkladem různých chorob (např. Fanconiho pancytopenie, xenoderma pigmentosum).
Vzniku mutací zabraňují [[reparační procesy DNA]], případně tzv. '''zpětné mutace'''. Ke zvýšené incidenci mutací dochází při defektu v [[gen|genech]] kódujících reparační enzymy (mutátorové geny), což je podkladem různých chorob (např. [[Fanconiho anémie|Fanconiho pancytopenie]], [[xeroderma pigmentosum]], [[Cockaynův syndrom]]).


== Rozdělení mutací ==
== Rozdělení mutací ==
Podle buněčné linie, která je mutací postižena:
*somatické mutace — podle povahy mutace bez projevu, nebo je příčinou spuštění procesu apoptózy, případně neoplasie
*mutace zárodečných buněk — pokud se projeví, může způsobit spontánní potrat nebo vrozené vady


Podle oblasti genomu a projevu:
===== Podle buněčné linie, která je mutací postižena: =====
*kódující oblasti — většinou způsobí patologii, podle toho, k jaké změně došlo (viz níže)
* '''somatické mutace''' — mutace, které nejsou zděděny od rodičů a nemohou být předány potomkům (nepostihují pohlavní buňky);
*nekódující oblasti — většinou se neprojeví a jedná se o tzv. '''tiché''' mutace, pokud ke změně nedošlo v následující nekódujících oblastech:
{{Příklad|
*[[promotor]]y, [[enhancer]]y a [[silencer]]y — ovlivňuje expresi genu; nesprávná exprese [[(Proto)onkogeny|protoonkogenů]] a [[Onkosupresorové geny|onkosupresorových genů]] je příčinou nádorového bujení
Mutace v genu ''p53'' v buňce střevního adenomu, způsobující jeho přechod do kolorektálního karcinomu.
*[[introny]] — může docházet k tzv. exonizaci intronu a pak se jedná o '''sestřihové''' mutace; speciálně se vyčleňují
}}
*'''kryptické''' mutace — v oblastech velmi podobných místům sestřihu
 
* '''mutace zárodečných buněk''' (zarodečné, germline mutace) — mutace, které mohou být zděděny od rodičů a mohou být předány potomkům (postihují pohlavní buňky)
{{Příklad|
Mutace v genu ''APC'' pohlavní buňky, způsobující familiární adenomatózní polypózu.
}}
 
===== Podle oblasti genomu a projevu: =====
* '''kódující oblasti''' — většinou způsobí patologii, podle toho, k jaké změně došlo (viz níže);
* '''nekódující oblasti''' — většinou se neprojeví a jedná se o tzv. '''tiché''' mutace, pokud ke změně nedošlo v následujících nekódujících oblastech:
:* [[promotor]]y, [[Transkripce|enhancery]] a silencery — ovlivňují expresi genu; nesprávná exprese [[(Proto)onkogeny|protoonkogenů]] a [[Tumor supresorové geny|onkosupresorových genů]] je pak příčinou [[Charakteristika nádorového bujení|nádorového bujení]];
:* [[introny]] může docházet k tzv. exonizaci intronu a pak se jedná o '''sestřihové''' mutace; speciálně se vyčleňují.
* '''kryptické''' mutace v oblastech velmi podobných místům sestřihu.
[[Soubor:Tranzice Transverze.svg|náhled|290x290pixelů|Schéma substituční bodové mutace nukleotidů]]
 
===== Podle změny genetické informace: =====
* '''bodové mutace''' — změna v jednom [[nukleotid]]u: může se jednat o:
:# ''deleci'',
:# ''inzerci'',
:# ''substituci'':
:## '''tranzice''' — změna purinu na purin nebo [[pyrimidin]]u na pyrimidin (C → T, T → C, A → G, G → A);
:## '''transverze''' — změna purinu na pyrimidin nebo naopak (A → T, T → A, C → A, A → C, G → T, T → G, G → C, C → G).
::* projevy se odvíjejí od toho, jestli [[Genetický kód|kodon]] se zaměněnou bází kóduje [[aminokyselina|aminokyselinu]] stejnou, jinou, nebo žádnou:
:::# '''samesense (silent)''' — jedná se o tzv. tichou mutaci (je zařazena stejná aminokyselina);
:::# '''missense''' — zařadí se jiná aminokyselina a může tak být změněna až znemožněna funkce genového produktu;
:::# '''nonsense''' — substituce zapříčiní vznik nového stop kodonu a tím kratšího genového produktu, jenž bude pravděpodobně nefunkční.
 
{{Poznámka |
K bodovým mutacím je nejnáchylnější cytosin, který snadno podléhá zejména spontánní deaminaci na uracil. Polymerázy jej pak chybně čtou jako T, takže dochází k tranzici C·G páru za T·A pár, a zapojení opravných mechanismů může vést i k jiným typům změn. Poločas cytosinu může být za určitých podmínek kolem 19 dní. Ostatní báze jsou mnohem stabilnější, jejich poločas se pohybuje kolem jednoho roku.<ref>{{Citace
| typ = článek
| příjmení1 = Gaudelli
| jméno1 = Nicole M.
| příjmení2 = Komor
| jméno2 = Alexis C.
| příjmení3 = Rees
| jméno3 = Holly A.
| článek = Programmable base editing of A•T to G•C in genomic DNA without DNA cleavage
| časopis = Nature
| rok = 2017
| ročník = 7681
| svazek = 551
| strany = 464-471
| issn = 0028-0836
| doi = 10.1038/nature24644}}</ref>
}}
 
 
* mutace rozsáhlejších oblastí:
** '''delece''' — způsobí, že bude ve výsledném [[Bílkoviny (1. LF UK, NT)|proteinu]] méně aminokyselin. Zároveň, pokud počet deletovaných nukleotidů '''není násobek tří''', dochází k '''frameshiftu''' – s velkou pravděpodobností se v blízkém okolí vyskytne nově vzniklý stop [[Kodony (tabulka)|kodon]] a protein bude nejspíše nefunkční;
** '''inzerce''' — do výsledného proteinu se zařadí více aminokyselin, obdobně jako u delece může docházet k '''frameshiftu''';
** '''jiné''' [[strukturní chromosomové aberace]].
 
* '''chromozomové''' - změna struktury chromozomů ([[Strukturní chromozomové aberace|chromozomové aberace]]),
* '''genomové''' - změna počtu chromozomů.


Podle změny genetické informace:
[[Soubor:Notable mutations.svg|800px|střed|Příklady klinicky významných mutací]]
*bodové mutace &mdash; změna v jednom [[nukleotid]]u: může se jednat o deleci (analogické mutacím rozsáhlejších oblastí), inzerci (taktéž) nebo '''substituci''':
{{pahýl}}
*#tranzice &mdash; změna [[purin]]u na purin nebo [[pyrimidin]]u na pyrimidin (C → T, T → C, A → G, G → A)
*#transverze &mdash; změna purinu na pyrimidin nebo naopak (A → T, T → A, C → A, A → C, G → T, T → G, G → C, C → G)
:projevy se odvíjejí od toho, jestli [[kodon]] se zaměněnou bází kóduje [[aminokyselina|aminokyselinu]] stejnou, jinou, nebo žádnou:
:#samesence &mdash; jedná se o tichou mutaci
:#missence &mdash; zařadí se jiná aminokyselina a může tak být změněna až znemožněna funkce genového produktu
:#nonsence &mdash; substituce zapříčiní vznik nového stop kodonu a tím kratšího genového produktu, jenž bude pravděpodobně nefunkční
*mutace rozsáhlejších oblastí
**delece &mdash; způsobí, že bude ve výsledném proteinu méně aminokyselin, zároveň pokud počet deletovaných nukleotidů '''není násobek tří''', dochází k '''frameshiftu''', s velkou pravděpodobností se v blízkém okolí vyskytne nově vzniklů stop kodon a protein bude nejspíše nefunkční
**inzerce &mdash; do výsledného proteinu se zařadí více aminokyselin, obdobně jako u delece může docházet k '''frameshiftu'''
**jiné strukturní chromosomové aberace


== Literatura ==
<noinclude>
{{Citace
 
== Odkazy ==
=== Související články ===
* [[Nádory]]
* [[Apoptóza]]
* [[Nestabilita repetitivních sekvencí|Dynamické mutace]]
* [[Evoluce]]
* [[Vrozené vady]]
* [[(Proto)onkogeny]]
* [[Tumor supresorové geny|Onkosupresorové geny]]
* [[Mutatorové geny, stabilita buněčného genomu|Mutátorové geny]]
* [[Fanconiho anémie|Fanconiho pancytopenie]]
* [[Xeroderma pigmentosum]]
* [[Chromozomální abnormality]]
* [[Genetický kód]]
=== Použitá literatura ===
* {{Citace
|typ = kniha
|typ = kniha
|korporace =  
|korporace =  
Řádek 49: Řádek 109:
|rok =  1997
|rok =  1997
|rozsah = 86
|rozsah = 86
|strany = 63 - 66
|strany = 63 66
|edice =  
|edice =  
|svazek =  
|svazek =  
|isbn = 382-228-97
|isbn = 80-7184-581-7}}
}}
=== Reference ===
== Související články ==
<references />
*[[Mutačně-selekční rovnováha]]
</noinclude>
*[[Nádory]]
*[[Apoptóza]]
*[[Evoluce]]
*[[Vrozené vady]]
*[[(Proto)onkogeny]]
*[[Onkosupresorové geny]]
*[[Mutátorové geny]]
*[[Fanconiho pancytopenie]]
*[[Xenoderma pigmentosum]]
*[[Chromosomové aberace]]
*[[Genetický kód]]


[[Kategorie:Lékařská biologie a genetika]]
[[Kategorie:Genetika]]
[[Kategorie:Molekulární biologie]]
[[Kategorie:Chemie]]
[[Kategorie:Biochemie]]

Aktuální verze z 1. 1. 2025, 14:57

Poškození molekuly DNA UV zářením

Mutace je změna genetické informace. Způsobují ji různé vlivy – nejčastěji se za mutageny považují:

  • fyzikální faktory (UV a ionizující záření);
  • chemické faktory (např. planární aromatické sloučeniny, silná oxidans, radikálové iniciátory);
  • biologické faktory (virové infekce atp.).

Jedná se o náhodný proces, ale zároveň bylo prokázáno, že v některých oblastech genomu k mutacím dochází častěji a jsou označované jako hot-spots.

Mutace, pokud se projeví (viz níže), může způsobit vážné onemocnění, ať už různé vrozené vady nebo neoplazie. Je ovšem zároveň považována za jeden z mechanismů evoluce.

Vzniku mutací zabraňují reparační procesy DNA, případně tzv. zpětné mutace. Ke zvýšené incidenci mutací dochází při defektu v genech kódujících reparační enzymy (mutátorové geny), což je podkladem různých chorob (např. Fanconiho pancytopenie, xeroderma pigmentosum, Cockaynův syndrom).

Rozdělení mutací[upravit | editovat zdroj]

Podle buněčné linie, která je mutací postižena:[upravit | editovat zdroj]
  • somatické mutace — mutace, které nejsou zděděny od rodičů a nemohou být předány potomkům (nepostihují pohlavní buňky);
Mutace v genu p53 v buňce střevního adenomu, způsobující jeho přechod do kolorektálního karcinomu.
  • mutace zárodečných buněk (zarodečné, germline mutace) — mutace, které mohou být zděděny od rodičů a mohou být předány potomkům (postihují pohlavní buňky)
Mutace v genu APC pohlavní buňky, způsobující familiární adenomatózní polypózu.
Podle oblasti genomu a projevu:[upravit | editovat zdroj]
  • kódující oblasti — většinou způsobí patologii, podle toho, k jaké změně došlo (viz níže);
  • nekódující oblasti — většinou se neprojeví a jedná se o tzv. tiché mutace, pokud ke změně nedošlo v následujících nekódujících oblastech:
  • kryptické mutace — v oblastech velmi podobných místům sestřihu.
Schéma substituční bodové mutace nukleotidů
Podle změny genetické informace:[upravit | editovat zdroj]
  • bodové mutace — změna v jednom nukleotidu: může se jednat o:
  1. deleci,
  2. inzerci,
  3. substituci:
    1. tranzice — změna purinu na purin nebo pyrimidinu na pyrimidin (C → T, T → C, A → G, G → A);
    2. transverze — změna purinu na pyrimidin nebo naopak (A → T, T → A, C → A, A → C, G → T, T → G, G → C, C → G).
  • projevy se odvíjejí od toho, jestli kodon se zaměněnou bází kóduje aminokyselinu stejnou, jinou, nebo žádnou:
  1. samesense (silent) — jedná se o tzv. tichou mutaci (je zařazena stejná aminokyselina);
  2. missense — zařadí se jiná aminokyselina a může tak být změněna až znemožněna funkce genového produktu;
  3. nonsense — substituce zapříčiní vznik nového stop kodonu a tím kratšího genového produktu, jenž bude pravděpodobně nefunkční.


K bodovým mutacím je nejnáchylnější cytosin, který snadno podléhá zejména spontánní deaminaci na uracil. Polymerázy jej pak chybně čtou jako T, takže dochází k tranzici C·G páru za T·A pár, a zapojení opravných mechanismů může vést i k jiným typům změn. Poločas cytosinu může být za určitých podmínek kolem 19 dní. Ostatní báze jsou mnohem stabilnější, jejich poločas se pohybuje kolem jednoho roku.[1]


  • mutace rozsáhlejších oblastí:
    • delece — způsobí, že bude ve výsledném proteinu méně aminokyselin. Zároveň, pokud počet deletovaných nukleotidů není násobek tří, dochází k frameshiftu – s velkou pravděpodobností se v blízkém okolí vyskytne nově vzniklý stop kodon a protein bude nejspíše nefunkční;
    • inzerce — do výsledného proteinu se zařadí více aminokyselin, obdobně jako u delece může docházet k frameshiftu;
    • jiné strukturní chromosomové aberace.
  • chromozomové - změna struktury chromozomů (chromozomové aberace),
  • genomové - změna počtu chromozomů.
Příklady klinicky významných mutací



Odkazy[upravit | editovat zdroj]

Související články[upravit | editovat zdroj]

Použitá literatura[upravit | editovat zdroj]

  • SOUKUPOVÁ, Milena a František SOUKUP. Kapitoly z lékařské biologie a genetiky II. 1. vydání. Praha : Karolinum, 1997. 86 s. s. 63 – 66. ISBN 80-7184-581-7.

Reference[upravit | editovat zdroj]

  1. GAUDELLI, Nicole M., Alexis C. KOMOR a Holly A. REES. Programmable base editing of A•T to G•C in genomic DNA without DNA cleavage. Nature. 2017, roč. 7681, vol. 551, s. 464-471, ISSN 0028-0836. DOI: 10.1038/nature24644.