Proč bych se měl právě já učit R

R je volně dostupný programovací jazyk určený (nejen) pro statistickou analýzu dat. Díky své relativní jednoduchosti si získává stále větší oblibu i mezi zájemci mimo obory počítačových věd. Je velmi oblíben na akademické půdě, ale i v byznysu či ekonomických aplikacích. R jako vývojové, programovací nebo analytické prostředí úspěšně používají jak profesionálové v exaktních oborech včetně teoretické informatiky a intenzivně-výpočetních aplikací matematiky, tak nadšenci se zcela netechnickým backgroundem jako biologové, lékaři, sociologiové a mnozí další.

Důvody, proč začít s R

• S vědou (nejen) v biomedicíně to myslím vážně.
• Jsem medik a jednou bych se chtěl věnovat postgraduálnímu doktorskému studiu, kde jistojistě budu při vyhodnocování dat používat statistiku.
• Jsem lékař a hledám konečně efektivní nástroj pro analýzy svých výzkumů. I když nemám ambice si počítat statistiku do svých prací sám, chci se na data sám „podívat“ již během jejich sbírání.
• Vadí mi nutnost platit za licence komerčních statistických programů.
• Nejsem spokojen například s tím, že žádný komerční statistický software neumí spočítat Fisherův přesný test nad kontingenční tabulkou obecně větších rozměrů, mnohdy dokonce ani o něco větších než ${2}\times {2}$, třeba jen ${4}\times {4}$. Oproti tomu R dokáže Fisherův přesný test spočítat nad smysluplnou kontingenční tabulkou libovolných konečných rozměrů.
• Sbírám opakovaně data stejného charakteru a rád bych si jejich (před)zpracování automatizoval.
• Publikuji v odborných časopisech a rád bych do statě článku s Methodology and Statistical Analysis pravdivě psal, že „... all statistical analyses were performed using R language for statistical computing and graphics...“, protože existuje evidence, že citování R či jiných volných statistických nástrojů mnohdy zvyšuje pravděpodobnost citování takového článku.
• Tuším, že věda 2.0 v biomedicíně se bude provozovat nejen formou experimentů na živém (in vivo) či v laboratořích (in vitro), ale budou ji tvořit ze značné části počítačové modely a simulace (in silico), a chci na to být připraven.
• Uvědomuji si, že MS Excel v základním rozhraní neumí doteď vykreslit krabicový diagram. Zpracování dat v tabulkových procesorech a spoléhání se jen na ně je spjato s různými problémy, chybné výstupy z tabulkových procesorů dokonce vyvolaly některé vědecké skandály.
• Data již nějakou dobu (sám) analyzuji, ale vnímám již zmíněné nebo jiné nedostatky komerčních statistických software, a přemýšlím, který programovací jazyk s kvalitní dokumentací a živou podporou a komunitou se začít učit.

Odkazy

• Co je R
• Srovnání R s dalšími podobnými jazyky

Externí odkazy

• Domovská stránka jazyka R
• Potřebuji se učit R? Čtyři dobré důvody zkusit open-source platformu pro analýzu dat, anglicky

Literatura

• ZVÁRA, Karel. Základy statistiky v prostředí R. 1. vydání. Praha : Karolinum, 2013. Biomedicínská statistika; sv. 4. ISBN 978-80-246-2245-3.