Regulace genové exprese u eukaryot: Porovnání verzí
Z WikiSkript
m (Robot: kosmetické úpravy) |
m (doplnění odrážky před šablonu citace; kosmetické úpravy) |
||
| Řádek 1: | Řádek 1: | ||
# '''na úrovni [[chromosom]]u''' | # '''na úrovni [[chromosom]]u''' | ||
#* změna struktury | #* změna struktury | ||
#* '''efekt pozice''' = přenos [[gen]]ů z euchromatinu na heterochromatin = změna funkce | #* '''efekt pozice''' = přenos [[gen]]ů z euchromatinu na heterochromatin = změna funkce | ||
#* '''amplifikace''' = zmnožení počtu [[transkripce|transkribovaných]] genů | #* '''amplifikace''' = zmnožení počtu [[transkripce|transkribovaných]] genů | ||
#* '''translokace''' = přemístění struktur genu do regulační sféry silného '''promotoru''' | #* '''translokace''' = přemístění struktur genu do regulační sféry silného '''promotoru''' | ||
#* '''inzerce promotorů''' = zvýší expresi genů | #* '''inzerce promotorů''' = zvýší expresi genů | ||
#* dále i přestavby na úrovni [[DNA (nukleová kyselina)|DNA]] (delece, inzerce); ovlivnění sestřihu | #* dále i přestavby na úrovni [[DNA (nukleová kyselina)|DNA]] (delece, inzerce); ovlivnění sestřihu | ||
# '''regulace transkripce''' | # '''regulace transkripce''' | ||
#* '''RNA-polymerasa – I''' | #* '''RNA-polymerasa – I''' | ||
#** v jadérku – transkribuje prekurzor rRNA (15 proteinů) | #** v jadérku – transkribuje prekurzor rRNA (15 proteinů) | ||
#* '''RNA-polymerasa – II''' | #* '''RNA-polymerasa – II''' | ||
#** transkribuje všechny pre-[[mRNA]] (14 proteinů) | #** transkribuje všechny pre-[[mRNA]] (14 proteinů) | ||
#* '''RNA-polymerasa – III''' | #* '''RNA-polymerasa – III''' | ||
#** transkribuje všechny pre-tRNA (17 proteinů) | #** transkribuje všechny pre-tRNA (17 proteinů) | ||
#* regulace transkripce cis-elementy | #* regulace transkripce cis-elementy | ||
#* '''enhancery''' (zesilovače) / '''silencery''' (zeslabovače) | #* '''enhancery''' (zesilovače) / '''silencery''' (zeslabovače) | ||
#** enhancer se vytvořením kličky DNA přiblíží k promotoru, na který se naváží specifické proteiny – aktivátory | #** enhancer se vytvořením kličky DNA přiblíží k promotoru, na který se naváží specifické proteiny – aktivátory | ||
#** tato vazba brání napojení RNA-polymerasy na promotor | #** tato vazba brání napojení RNA-polymerasy na promotor | ||
#** teprve po změně konformace komplexu působením signálních molekul nebo navázáním koaktivátorů je promotor uvolněn pro polymerasu a dojde k zahájení transkripce | #** teprve po změně konformace komplexu působením signálních molekul nebo navázáním koaktivátorů je promotor uvolněn pro polymerasu a dojde k zahájení transkripce | ||
#* '''[[Transkripční faktory]]''' | #* '''[[Transkripční faktory]]''' | ||
#** '''Zinc-fingers''' = proteiny, jejichž řetězce vytvářejí krátké smyčky, kde je atom Zn<sup>2+</sup> vázán na 2 cysteiny a 2 histaminy; regulace transkripce 5S rRNA | #** '''Zinc-fingers''' = proteiny, jejichž řetězce vytvářejí krátké smyčky, kde je atom Zn<sup>2+</sup> vázán na 2 cysteiny a 2 histaminy; regulace transkripce 5S rRNA | ||
#** '''Leucinové zipy''' = spojují 2 α-helixy vazbami mezi molekulami leucinu | #** '''Leucinové zipy''' = spojují 2 α-helixy vazbami mezi molekulami leucinu | ||
#** '''HLH''' (helix – loop – helix) | #** '''HLH''' (helix – loop – helix) | ||
#** '''HTH''' (helix – turn – helix) | #** '''HTH''' (helix – turn – helix) | ||
#* '''Homeodomény''' | #* '''Homeodomény''' | ||
#* regulace transkripce mediátory = signální molekuly | #* regulace transkripce mediátory = signální molekuly | ||
#** koordinační činnost: | #** koordinační činnost: | ||
#*** parakrinní | #*** parakrinní | ||
#*** autokrinní | #*** autokrinní | ||
#*** endokrinní (hormony) | #*** endokrinní (hormony) | ||
# '''regulační genová kaskáda''' | # '''regulační genová kaskáda''' | ||
#* primárně regulované geny mohou přes svůj vlastní produkt následně regulovat i expresi dalších genů | #* primárně regulované geny mohou přes svůj vlastní produkt následně regulovat i expresi dalších genů | ||
#* celá regulační kaskáda může mít celou řadu mezistupňů | #* celá regulační kaskáda může mít celou řadu mezistupňů | ||
#* na konci regulační kaskády mohou vzniknout i takové faktory (produkty), které naopak utlumí aktivitu primárně regulovaných genů | #* na konci regulační kaskády mohou vzniknout i takové faktory (produkty), které naopak utlumí aktivitu primárně regulovaných genů | ||
<!-- prozatím schéma vynechávám; nahrazeno slovně a časem možno nahradit obrázkem --> | <!-- prozatím schéma vynechávám; nahrazeno slovně a časem možno nahradit obrázkem --> | ||
# '''regulace úpravou pre-mRNA''' | # '''regulace úpravou pre-mRNA''' | ||
#* po transkripci pre-mRNA a navázání 5´ čepičky v průběhu transkripce | #* po transkripci pre-mRNA a navázání 5´ čepičky v průběhu transkripce | ||
#* úprava pre-mRNA: | #* úprava pre-mRNA: | ||
#*# odštěpením 3´ konce a připojení poly(A) | #*# odštěpením 3´ konce a připojení poly(A) | ||
#*# sestřih intronů a spojení exonů | #*# sestřih intronů a spojení exonů | ||
| Řádek 45: | Řádek 45: | ||
# '''regulace na úrovni translace''' | # '''regulace na úrovni translace''' | ||
#* př. translace mRNA pro tvorbu ferritinu | #* př. translace mRNA pro tvorbu ferritinu | ||
# '''targeting''' | # '''targeting''' | ||
#* genetická determinace nasměrování proteinů | #* genetická determinace nasměrování proteinů | ||
| Řádek 56: | Řádek 56: | ||
=== Zdroj === | === Zdroj === | ||
{{Citace | * {{Citace | ||
|typ = web | |typ = web | ||
|příjmení1 = Štefánek | |příjmení1 = Štefánek | ||
Verze z 30. 10. 2016, 12:58
- na úrovni chromosomu
- změna struktury
- efekt pozice = přenos genů z euchromatinu na heterochromatin = změna funkce
- amplifikace = zmnožení počtu transkribovaných genů
- translokace = přemístění struktur genu do regulační sféry silného promotoru
- inzerce promotorů = zvýší expresi genů
- dále i přestavby na úrovni DNA (delece, inzerce); ovlivnění sestřihu
- regulace transkripce
- RNA-polymerasa – I
- v jadérku – transkribuje prekurzor rRNA (15 proteinů)
- RNA-polymerasa – II
- transkribuje všechny pre-mRNA (14 proteinů)
- RNA-polymerasa – III
- transkribuje všechny pre-tRNA (17 proteinů)
- regulace transkripce cis-elementy
- enhancery (zesilovače) / silencery (zeslabovače)
- enhancer se vytvořením kličky DNA přiblíží k promotoru, na který se naváží specifické proteiny – aktivátory
- tato vazba brání napojení RNA-polymerasy na promotor
- teprve po změně konformace komplexu působením signálních molekul nebo navázáním koaktivátorů je promotor uvolněn pro polymerasu a dojde k zahájení transkripce
- Transkripční faktory
- Zinc-fingers = proteiny, jejichž řetězce vytvářejí krátké smyčky, kde je atom Zn2+ vázán na 2 cysteiny a 2 histaminy; regulace transkripce 5S rRNA
- Leucinové zipy = spojují 2 α-helixy vazbami mezi molekulami leucinu
- HLH (helix – loop – helix)
- HTH (helix – turn – helix)
- Homeodomény
- regulace transkripce mediátory = signální molekuly
- koordinační činnost:
- parakrinní
- autokrinní
- endokrinní (hormony)
- koordinační činnost:
- RNA-polymerasa – I
- regulační genová kaskáda
- primárně regulované geny mohou přes svůj vlastní produkt následně regulovat i expresi dalších genů
- celá regulační kaskáda může mít celou řadu mezistupňů
- na konci regulační kaskády mohou vzniknout i takové faktory (produkty), které naopak utlumí aktivitu primárně regulovaných genů
- regulace úpravou pre-mRNA
- po transkripci pre-mRNA a navázání 5´ čepičky v průběhu transkripce
- úprava pre-mRNA:
- odštěpením 3´ konce a připojení poly(A)
- sestřih intronů a spojení exonů
- Další možnosti ovlivnění
- alternativní sestřih
- editace mRNA (změna struktury pre-mRNA)
- stabilita mRNA v cytoplazmě
- regulace na úrovni translace
- př. translace mRNA pro tvorbu ferritinu
- targeting
- genetická determinace nasměrování proteinů
Odkazy
Související články
Zdroj
- ŠTEFÁNEK, Jiří. Medicína, nemoci, studium na 1. LF UK [online]. [cit. 2009]. <http://www.stefajir.cz>.
