Replikace DNA
Z WikiSkript
Replikace je přenos informace z DNA do DNA, je to schopnost zajišťující dědičnost;
- při replikaci vzniknou z jedné mateřské molekuly DNA dvě naprosto stejné DNA dceřinné (každá s jedním vláknem z původní DNA - jedná se o semikonzervativní proces, kdy nově vzniklá dvoušroubovice má vždy jedno vlákno původní a druhé vlákno nově syntetizované)
- uplatňuje se při rozmnožování, kdy zajišťuje identitu genetické informace obou dceřinných buněk. Pro rozmnožování je nezbytné, aby potomek dostal plnohodnotnou genetickou informaci.
- rychlost replikace v živočišných buňkách se odhaduje na 0,5 – 0,15 μm/min, je to opravdu pomalý proces, proto probíhá na více místech současně
- místa, kde dochází k replikaci se nazývají replikony. Počet replikonů v buňce není konstantní, u rychle se množících buněk je jich více než u buněk množících se pomalu
- replikace neprobíhá na všech replikonech současně, obecně v replikonech lokalizovaných v heterochromatinu začíná později
- klíčovou roli při replikaci DNA mají enzymy zvané DNA polymerasy. U člověka se vyskytuje 5 druhů enzymů označované jako DNA dependentní DNA polymerasy (v živočišných buňkách pět typů)
pro všechny typy DNA polymeras platí:
- potřebují matrici = vlákno, ke kterému podle pravidel komplementace bazí vytvářejí doplněk
- při své práci vždy postupují od konce 5' ke konci 3'
- potřebují mít k dispozici volný konec 3´nukleotidu, na který připojí fosfodiesterickou vazbou 5´místo nově zařazeného nukleotidu. Nově zařazované nukleotidy jsou používány ve formě nukleotidtrifosfátů, odštěpením dvou makroergních vazeb je získávána potřebná energie pro uskutečnění vazby
- DNA polymerasa nemůže zahájit syntézu de novo, ale připojuje pouze nový nukleotid na 3´ pozici nukleotidu předchozího
- aby DNA polymeráza mohla zahájit připojování nukleotidů nového vlákna DNA, musí být vodíkové můstky (= nízkoenergetické vazby mezi oběma vlákny) nejprve narušeny enzymem primasou (= DNA dependentní RNA polymerasa). Místa kde tato narušení vzniknou jsou označovány jako replikační počátky. U bakterií bychom takovýto počátek našli pouze jeden.
- lidská DNA vytváří replikačních počátků okolo 10 000. To jí umožňuje zreplikovat se také v poměrně krátké době.
- primasa vytváří na začátku replikovaného úseku nového vlákna DNA krátký RNA primer („očko“). Na jeho 3´konec může DNA polymerasa připojit první nukleotid nového vlákna DNA
- vzhledem k tomu, že jsou obě vlákna DNA antiparalelní (konci 5´jednoho vlákna odpovídá konec 3´ vlákna druhého) a vzhledem k tomu, že DNA polymerasa syntetizuje „jednosměrně“ (od 5´ k 3´), může souvisle probíhat replikace pouze na jednom vlákně. Na tomto vlákně replikace (kterou provádí δ-polymerasa) probíhá rychleji a vlákno se označuje jako vlákno vedoucí
- na druhém (opožděném) vlákně probíhá replikace po částech – tzv. Okazakiho fragmentech. Replikace je pomalejší, je prováděna α-polymerasou, která má primasovou aktivitu
- Na procesu replikace se kromě uvedených DNA polymeras podílí řada enzymů, jejichž úlohou je rozvinout suprahelikální strukturu (gyrasa), rozvinout Watson-Crickovu dvoušroubovici (helikasy)
- poté co jsou k předlohovým (templátovým) vláknům dosyntetizována vlákna nová, je replikace DNA dokončena.
- DNA polymeráza udělá 1 chybu asi na 107 zreplikovaných bází (teoreticky mohou vznikat i dvojice G-T a A-C, jsou ovšem mnohem méně stabilní), navíc má sama korekční funkci (v případě chyby provádí i opravu, spočívající ve vystřižení a zařazení správné base). Touto metodou jsou pravděpodobně odstraněna i očka RNA a pak enzym ligasa spojí jednotlivé fragmenty do souvislého řetězce.
Odkazy
Související články
Reference
Nekompletní citace webu. ŠTEFÁNEK, Jiří. Medicína, nemoci, studium na 1. LF UK [online]. <http://www.stefajir.cz>.