Nukleotid
Nukleotid je fosforylovaný nukleosid. Ve své molekule obsahuje pětiuhlíkatý cukr - pentosu, kterým je v DNA 2'-deoxyribosa a v RNA ribosa. N-glykosidickou vazbou je k pentose připojena na 1'C uhlíku dusíkatá base (v DNA je to Adenin a Guanin - purinové; Cytosin a Thymin - pyrimidinové a v RNA místo Thyminu Uracil - pyrimidinová base). Na 5'C pentosy jsou přes esterovou vazbu připojeny tři zbytky kyseliny fosforečné - "anorganické" fosfáty a jsou spojeny mezi sebou dvěma fosfodiesterovými vazbami. Jednotlivé fosfory v tomto trifosfátu jsou označeny v pořadí od pentosy α, β a γ. Odštěpený difosfát (β a γ) se nazývá pyrofosfát.
Funkce:
- Fyziologicky jsou nukleotidtrifosfáty substrátem pro replikaci DNA, kterou uskutečňují DNA polymerasy. Energie pro vytvoření vazby mezi dvěma nukleotidy je získána z makroergní vazby P~P odštěpeného pyrofosfátu. Jednotlivé nukleotidy jsou zařazovány do řetezce ve směru 5'→3'. Vznikající řetězec nazýváme polynukleotid.
- Uměle připravené dNTPs (deoxyriboNucleotideTriPhosphates) se používají v molekulární biologii pro PCR.
- Pro Sengerovu metodu sekvenování se také používají ddNTPs (dideoxyNTPs), kterým chybí kyslík i na 3'C.
Odkazy
Související články
Reference
Použitá literatura
MATOUŠ, Bohuslav, et al. Základy lékařské chemie a biochemie. 2010. vydání. Praha : Galen, 2010. 0 s. ISBN 978-80-7262-702-8.
