Nukleotid: Porovnání verzí

Verze z 29. 6. 2018, 21:31

Struktura nukleotidu.

Nukleotid je fosforylovaný nukleosid. Ve své molekule obsahuje pětiuhlíkatý cukr − pentózu, kterým je v DNA 2'-deoxyribosa a v RNA ribosa. N-glykosidickou vazbou je k pentóze připojena na 1'C uhlíku dusíkatá base (v DNA je to Adenin a Guanin − purinové; Cytosin a Thymin − pyrimidinové a v RNA místo Thyminu Uracil − pyrimidinová base). Na 5'C pentózy jsou přes esterovou vazbu připojeny tři zbytky kyseliny fosforečné − "anorganické" fosfáty a jsou spojeny mezi sebou dvěma fosfodiesterovými vazbami. Jednotlivé fosfory v tomto trifosfátu jsou označeny v pořadí od pentózy α, β a γ. Odštěpený difosfát (β a γ) se nazývá pyrofosfát. Při odštěpení prvního fosfátu od konce molekuly nukleotidu se uvolní 30 kJ/mol energie, při odštěpení druhého se uvolní 36 kJ/mol.

Funkce:

Fyziologicky jsou nukleotidtrifosfáty substrátem pro replikaci DNA, kterou uskutečňují DNA polymerasy. Energie pro vytvoření vazby mezi dvěma nukleotidy je získána z makroergní vazby P~P odštěpeného pyrofosfátu. Jednotlivé nukleotidy jsou zařazovány do řetězce ve směru 5'→3'. Vznikající řetězec nazýváme polynukleotid.
Uměle připravené dNTPs (deoxyriboNucleotideTriPhosphates) se používají v molekulární biologii pro PCR.
Pro Sangerovu metodu sekvenování se také používají ddNTPs (dideoxyNTPs), kterým chybí kyslík i na 3'C.

Odkazy

Související články

Použitá literatura

MATOUŠ, Bohuslav, et al. Základy lékařské chemie a biochemie. 2010. vydání. Praha : Galen, 2010. 540 s. ISBN 978-80-7262-702-8.

@@ Řádek 1: / Řádek 1: @@
-<noinclude>{{Heslo
+<noinclude>{{Heslo}}</noinclude>
-|cze = nukleotid
+[[Soubor:Nucleotides.png|350px|náhled|Struktura nukleotidu.]]
-|eng = nucleotide}}</noinclude>
-[[Soubor:Nucleotides.png|350px|thumb|Struktura nukleotidu.]]
-Nukleotid je fosforylovaný nukleosid. Ve své molekule obsahuje pětiuhlíkatý cukr − pentózu, kterým je v [[DNA (nukleová kyselina)|DNA]] 2'-deoxyribosa a v [[RNA]] ribosa. N-glykosidickou vazbou je k pentóze připojena na 1'C uhlíku [[Dusíkaté báze|dusíkatá base]] (v [[DNA (nukleová kyselina)|DNA]] je to '''A'''denin a '''G'''uanin − purinové; '''C'''ytosin a '''T'''hymin − pyrimidinové a v RNA místo '''T'''hyminu '''U'''racil − pyrimidinová base). Na 5'C pentózy jsou přes esterovou vazbu připojeny tři zbytky [[Kyselina trihydrogenfosforečná|kyseliny fosforečné]] − "anorganické" [[Fosfát|fosfáty]] a jsou spojeny mezi sebou dvěma fosfodiesterovými vazbami. Jednotlivé fosfory v tomto trifosfátu jsou označeny v pořadí od pentózy α, β a γ. Odštěpený difosfát (β a γ) se nazývá pyrofosfát. Při odštěpení prvního fosfátu od konce molekuly nukleotidu se uvolní 30 kJ/mol energie, při odštěpení druhého se uvolní 36 kJ/mol.
+Nukleotid je fosforylovaný nukleosid. Ve své molekule obsahuje pětiuhlíkatý cukr − pentózu, kterým je v [[DNA (nukleová kyselina)|DNA]] 2'-deoxyribosa a v [[RNA]] ribosa. N-glykosidickou vazbou je k pentóze připojena na 1'C uhlíku [[Dusíkaté báze|dusíkatá base]] (v [[DNA (nukleová kyselina)|DNA]] je to '''A'''denin a '''G'''uanin − purinové; '''C'''ytosin a '''T'''hymin − pyrimidinové a v RNA místo '''T'''hyminu '''U'''racil − pyrimidinová base). Na 5'C pentózy jsou přes esterovou vazbu připojeny tři zbytky [[Kyselina trihydrogenfosforečná|kyseliny fosforečné]] − "anorganické" [[fosfát]]y a jsou spojeny mezi sebou dvěma fosfodiesterovými vazbami. Jednotlivé fosfory v tomto trifosfátu jsou označeny v pořadí od pentózy α, β a γ. Odštěpený difosfát (β a γ) se nazývá pyrofosfát. Při odštěpení prvního fosfátu od konce molekuly nukleotidu se uvolní 30 kJ/mol energie, při odštěpení druhého se uvolní 36 kJ/mol.