Nukleotid: Porovnání verzí
Z WikiSkript
Bez shrnutí editace |
Bez shrnutí editace |
||
| Řádek 1: | Řádek 1: | ||
==Struktura== | |||
Nukleotid je fosforylovaný nukleosid. Ve své molekule obsahuje pětiuhlíkatý cukr - pentosu, kterým je v [[DNA (nukleová kyselina)|DNA]] 2'-deoxyribosa a v [[RNA]] ribosa. N-glykosidickou vazbou je k pentose připojena na 1'C uhlíku [[Dusíkaté báze|dusíkatá base]] (v [[DNA (nukleová kyselina)|DNA]] je to '''A'''denin a '''G'''uanin - purinové; '''C'''ytosin a '''T'''hymin - pyrimidinové a v RNA místo '''T'''hyminu '''U'''racil - pyrimidinová base). Na 5'C pentosy jsou přes esterovou vazbu připojeny tři zbytky [[Kyselina trihydrogenfosforečná|kyseliny fosforečné]] - "anorganické" [[Fosfát|fosfáty]] a jsou spojeny mezi sebou dvěma fosfodiesterovými vazbami. Jednotlivé fosfory v tomto trifosfátu jsou označeny v pořadí od pentosy α, β a γ. Odštěpený difosfát (β a γ) se nazývá pyrofosfát. | Nukleotid je fosforylovaný nukleosid. Ve své molekule obsahuje pětiuhlíkatý cukr - pentosu, kterým je v [[DNA (nukleová kyselina)|DNA]] 2'-deoxyribosa a v [[RNA]] ribosa. N-glykosidickou vazbou je k pentose připojena na 1'C uhlíku [[Dusíkaté báze|dusíkatá base]] (v [[DNA (nukleová kyselina)|DNA]] je to '''A'''denin a '''G'''uanin - purinové; '''C'''ytosin a '''T'''hymin - pyrimidinové a v RNA místo '''T'''hyminu '''U'''racil - pyrimidinová base). Na 5'C pentosy jsou přes esterovou vazbu připojeny tři zbytky [[Kyselina trihydrogenfosforečná|kyseliny fosforečné]] - "anorganické" [[Fosfát|fosfáty]] a jsou spojeny mezi sebou dvěma fosfodiesterovými vazbami. Jednotlivé fosfory v tomto trifosfátu jsou označeny v pořadí od pentosy α, β a γ. Odštěpený difosfát (β a γ) se nazývá pyrofosfát. | ||
==Funkce== | |||
* Fyziologicky jsou nukleotidtrifosfáty substrátem pro replikaci [[DNA (nukleová kyselina)|DNA]], kterou uskutečňují DNA polymerasy. Energie pro vytvoření vazby mezi dvěma nukleotidy je získána z makroergní vazby P~P odštěpeného pyrofosfátu. Jednotlivé nukleotidy jsou zařazovány do řetezce ve směru 5'→3'. Vznikající řetězec nazýváme polynukleotid. | |||
* Uměle připravené dNTPs (deoxyriboNucleotideTriPhosphates) se používají v molekulární biologii pro [[PCR]]. | |||
* Pro [[Sekvenování|Sengerovu metodu sekvenování]] se také používají ddNTPs (dideoxyNTPs), kterým chybí kyslík i na 3C'. | |||
{{Pahýl}} | {{Pahýl}} | ||
Verze z 18. 1. 2012, 21:33
Struktura
Nukleotid je fosforylovaný nukleosid. Ve své molekule obsahuje pětiuhlíkatý cukr - pentosu, kterým je v DNA 2'-deoxyribosa a v RNA ribosa. N-glykosidickou vazbou je k pentose připojena na 1'C uhlíku dusíkatá base (v DNA je to Adenin a Guanin - purinové; Cytosin a Thymin - pyrimidinové a v RNA místo Thyminu Uracil - pyrimidinová base). Na 5'C pentosy jsou přes esterovou vazbu připojeny tři zbytky kyseliny fosforečné - "anorganické" fosfáty a jsou spojeny mezi sebou dvěma fosfodiesterovými vazbami. Jednotlivé fosfory v tomto trifosfátu jsou označeny v pořadí od pentosy α, β a γ. Odštěpený difosfát (β a γ) se nazývá pyrofosfát.
Funkce
- Fyziologicky jsou nukleotidtrifosfáty substrátem pro replikaci DNA, kterou uskutečňují DNA polymerasy. Energie pro vytvoření vazby mezi dvěma nukleotidy je získána z makroergní vazby P~P odštěpeného pyrofosfátu. Jednotlivé nukleotidy jsou zařazovány do řetezce ve směru 5'→3'. Vznikající řetězec nazýváme polynukleotid.
- Uměle připravené dNTPs (deoxyriboNucleotideTriPhosphates) se používají v molekulární biologii pro PCR.
- Pro Sengerovu metodu sekvenování se také používají ddNTPs (dideoxyNTPs), kterým chybí kyslík i na 3C'.
