KIT: Porovnání verzí
Feedback

Z WikiSkript

m (typo)
m (→‎Gen KIT: obrahují → obsahují)
 
(Nejsou zobrazeny 3 mezilehlé verze od 2 dalších uživatelů.)
Řádek 1: Řádek 1:
'''KIT''' je gen pro tyrozinkinázový receptor (CD117, SCFR, c-Kit) pro růstový faktor [[SCF]]. Zároveň jde o [[Protoonkogen|protoonkogen]], který má i svůj virový protějšek v-Kit (virus sarkomu koček FeSV-4). Receptor c-Kit hraje důležitou úlohu v [[Hematopoeza|krvetvorbě]], tvorbě [[Melanin|melaninu]], fertilitě a pohyblivosti střev. Poruchy signalizace zprostředkované receptorem c-Kit byly popsány v řadě patologický stavů, zejm. u některých nádorů a alergií, ale také např. u [[Piebaldismus|piebaldismu]] (parciální albinismus). Receptor c-Kit je možno farmakologicky blokovat.
'''KIT''' je gen pro tyrozinkinázový receptor (CD117, SCFR, c-Kit) pro růstový faktor [[SCF]]. Zároveň jde o [[protoonkogen]], který má i svůj virový protějšek v-Kit (virus sarkomu koček FeSV-4). Receptor c-Kit hraje důležitou úlohu v [[Hematopoeza|krvetvorbě]], tvorbě [[melanin]]u, fertilitě a pohyblivosti střev. Poruchy signalizace zprostředkované receptorem c-Kit byly popsány v řadě patologický stavů, zejm. u některých nádorů a alergií, ale také např. u [[Piebaldismus|piebaldismu]] (parciální albinismus). Receptor c-Kit je možno farmakologicky blokovat.


== Molekulární biologie ==
== Molekulární biologie ==
=== Gen KIT ===
=== Gen KIT ===
Gen KIT se nachází na chromosomu 4 v segmentu 4q11. Gen je dlouhý více než 34 kb DNA, skládá se z 21 exonů. První exon kóduje inicializační sekvence, druhý až devátý exon kódují extracelulární část receptoru, desátý exon kóduje transmembránovou část receptoru a zbývající exony kódují intracelulární část receptoru. Promotorové sekvence genu KIT obrahují místa vázající regulační proteiny [[AP-2]], [[bHLH]], [[Sp1]], [[Ets]], [[Ets-2]] a [[Myb]].
Gen KIT se nachází na chromosomu 4 v segmentu 4q11. Gen je dlouhý více než 34 kb DNA, skládá se z 21 exonů. První exon kóduje inicializační sekvence, druhý až devátý exon kódují extracelulární část receptoru, desátý exon kóduje transmembránovou část receptoru a zbývající exony kódují intracelulární část receptoru. Promotorové sekvence genu KIT obsahují místa vázající regulační proteiny [[AP-2]], [[bHLH]], [[Sp1]], [[Ets]], [[Ets-2]] a [[Myb]].


Dalšími regulačními faktory podílejícími se na regulaci exprese genu KIT jsou [[miRNA]] (miR-221 a miR-222).
Dalšími regulačními faktory podílejícími se na regulaci exprese genu KIT jsou [[miRNA]] (miR-221 a miR-222).
Řádek 9: Řádek 9:
=== Struktura receptoru ===
=== Struktura receptoru ===
Receptor c-Kit je tyrozinkináza typu III, sruktura je velmi podobná ostatním receptorům této skupiny. Receptor prochází jednou přes membránu, extracelulárně je jeho N-terminální konec. Na receptoru lze rozlišit následující domény (postupně od N-terminálního konce):
Receptor c-Kit je tyrozinkináza typu III, sruktura je velmi podobná ostatním receptorům této skupiny. Receptor prochází jednou přes membránu, extracelulárně je jeho N-terminální konec. Na receptoru lze rozlišit následující domény (postupně od N-terminálního konce):
* pět imunoglobulinových domén,  
* pět imunoglobulinových domén,
* GNNK sekvence (Gly-Asn-Asn-Lys sekvence),
* GNNK sekvence (Gly-Asn-Asn-Lys sekvence),
* transmembránová doména,
* transmembránová doména,
Řádek 16: Řádek 16:
* do kinázy vložená sekvence,
* do kinázy vložená sekvence,
* tyrozinkinázová doména 2,
* tyrozinkinázová doména 2,
* C-terminální konec.
* C-terminální konec.
    
    
Alternativní sestřih mRNA vede k existenci několika variant receptoru. K alternativnímu sestřihu dochází ve dvou místech:
Alternativní sestřih mRNA vede k existenci několika variant receptoru. K alternativnímu sestřihu dochází ve dvou místech:
Řádek 22: Řádek 22:
* v sekvenci vložené do kinázy může být vložen serinový zbytek.
* v sekvenci vložené do kinázy může být vložen serinový zbytek.


Tedy existují nejmnéně čtyři isoformy receptoru. V postmeiotických zárodečných buňkách je dále přítomen výrazně zkrácený transkript tr-Kit, který je tvořen pouze druhou tyrozinkinázovou doménou a C-terminálním koncem.  
Tedy existují nejmnéně čtyři isoformy receptoru. V postmeiotických zárodečných buňkách je dále přítomen výrazně zkrácený transkript tr-Kit, který je tvořen pouze druhou tyrozinkinázovou doménou a C-terminálním koncem.


=== Aktivace receptoru ===
=== Aktivace receptoru ===
[[Image:Kit ligand 2E9W.png|thumb|250px|Model aktivovaného receptoru SCFR. Zeleně je vyznačen ligand, šedě dvojice proteinů c-Kit.]]
[[Soubor:Kit ligand 2E9W.png|náhled|250px|Model aktivovaného receptoru SCFR. Zeleně je vyznačen ligand, šedě dvojice proteinů c-Kit.]]
Receptor se aktivuje dimerizací. Ligand se musí navázat na imunoglobulinové domény 1–3. Tím se imunoglobulinové domény 4–5 přiblíží natolik, že mohou interagovat a navzájem se navázat. Následné přiblížení transmembránových domén a zřejmě i indukce změn v konformaci vedou k vzájemné fosforylaci tyrozinových zbytků juxtamembránových domén, sekvence vložené do kinázy a C-terminálního konce proteinu.  
Receptor se aktivuje dimerizací. Ligand se musí navázat na imunoglobulinové domény 1–3. Tím se imunoglobulinové domény 4–5 přiblíží natolik, že mohou interagovat a navzájem se navázat. Následné přiblížení transmembránových domén a zřejmě i indukce změn v konformaci vedou k vzájemné fosforylaci tyrozinových zbytků juxtamembránových domén, sekvence vložené do kinázy a C-terminálního konce proteinu.




Řádek 37: Řádek 37:


=== Fyziologická funkce ===
=== Fyziologická funkce ===
Receptor c-Kit má četné funkce během embryonálního vývoje i v dospělosti.  
Receptor c-Kit má četné funkce během embryonálního vývoje i v dospělosti.


*'''Krvetvorba'''. Receptor je exprimován v buňkách časných stádií krvetvorby, během vyzrávání exprese mizí. Signalizace z receptoru c-Kit je důležitým signálem podporujícím proliferaci a přežívání. V případě [[Žírná buňka|žírných buněk]] a [[Dendritická buňka|dendritických buněk]] je receptor přítomen i u zralých buněk.
* '''Krvetvorba'''. Receptor je exprimován v buňkách časných stádií krvetvorby, během vyzrávání exprese mizí. Signalizace z receptoru c-Kit je důležitým signálem podporujícím proliferaci a přežívání. V případě [[Žírná buňka|žírných buněk]] a [[Dendritická buňka|dendritických buněk]] je receptor přítomen i u zralých buněk.
*'''Pigmentace'''. Signalizace zprostředkovaná c-Kit receptorem podmiňuje přežívání, proliferaci a migraci melanocytů během embryogeneze.  
* '''Pigmentace'''. Signalizace zprostředkovaná c-Kit receptorem podmiňuje přežívání, proliferaci a migraci melanocytů během embryogeneze.
*'''Reprodukce'''. Signalizace zprostředkovaná receptorem c-Kit chrání zárodečné buňky před apoptózou, zprostředkovává jejich migraci a proliferaci. Signalizace c-Kit významným způsobem interaguje se signalizací ve dráze [[PI3K]]/[[Akt]].  
* '''Reprodukce'''. Signalizace zprostředkovaná receptorem c-Kit chrání zárodečné buňky před apoptózou, zprostředkovává jejich migraci a proliferaci. Signalizace c-Kit významným způsobem interaguje se signalizací ve dráze [[PI3K]]/[[Akt]].
*'''Gastrointestinální trakt'''. Signalizace c-Kit je klíčová pro Cajalovy intestinální buňky, bez dostatečné signalizace tyto buňky mizí a dochází k poruchám střevní motility.
* '''Gastrointestinální trakt'''. Signalizace c-Kit je klíčová pro Cajalovy intestinální buňky, bez dostatečné signalizace tyto buňky mizí a dochází k poruchám střevní motility.
*'''Nervový systém'''. V pokusech na myších s porušenou funkcí receptoru c-Kit, resp. s mutací růstového faktoru SCF, byla prokázána porucha učení. Fyziologicky je KIT exprimován v oblastech neuroproliferace.  
* '''Nervový systém'''. V pokusech na myších s porušenou funkcí receptoru c-Kit, resp. s mutací růstového faktoru SCF, byla prokázána porucha učení. Fyziologicky je KIT exprimován v oblastech neuroproliferace.
*'''Kardiovaskulární systém'''. Signalizace SCF hraje roli v řadě fyziologických i patologických procesů zahrnujících diferenciaci srdečních kmenových buněk i konečnou diferenciaci kardiomyocytů a vaskulární proliferaci.
* '''Kardiovaskulární systém'''. Signalizace SCF hraje roli v řadě fyziologických i patologických procesů zahrnujících diferenciaci srdečních kmenových buněk i konečnou diferenciaci kardiomyocytů a vaskulární proliferaci.
*'''Plíce'''. U pokusných myší s defektním genem KIT se spontánně vyvíjí emfyzém a mění se mechanické vlastnosti plic. Příčina prozatím není známá, ale předpokládá se, že jde o vliv regulace zprostředkované c-Kit na úrovni plicního epitelu.
* '''Plíce'''. U pokusných myší s defektním genem KIT se spontánně vyvíjí emfyzém a mění se mechanické vlastnosti plic. Příčina prozatím není známá, ale předpokládá se, že jde o vliv regulace zprostředkované c-Kit na úrovni plicního epitelu.


   
   
== Molekulární patologie ==
== Molekulární patologie ==
=== Nádorová onemocnění ===  
=== Nádorová onemocnění ===
Mutace genu KIT byla prokázána u četných nádorů:
Mutace genu KIT byla prokázána u četných nádorů:
* malobuněčný karcinom plic,
* malobuněčný karcinom plic,
Řádek 60: Řádek 60:


=== Imunitní poruchy ===
=== Imunitní poruchy ===
Protože exprese genu KIT zůstává zachována u žírných buněk a u dendritických buněk, představuje signalizace zprostředkovaná c-Kit jeden z faktorů, který se může podílet na rozvoji astma a alergie, případně který může být zajímavým terapeutickým cílem.  
Protože exprese genu KIT zůstává zachována u žírných buněk a u dendritických buněk, představuje signalizace zprostředkovaná c-Kit jeden z faktorů, který se může podílet na rozvoji astma a alergie, případně který může být zajímavým terapeutickým cílem.
   
   
== Využití v histopatologii ==
== Využití v histopatologii ==
Řádek 67: Řádek 67:
* cytoplazmatické barvení: gastrointestinální stromální tumor;
* cytoplazmatické barvení: gastrointestinální stromální tumor;
* perinukleární tečkování (barvení Golgiho aparátu): gastrointestinální stromální tumor, seminom;
* perinukleární tečkování (barvení Golgiho aparátu): gastrointestinální stromální tumor, seminom;
* povrch lumin: adenoidně cystický karcinom.  
* povrch lumin: adenoidně cystický karcinom.




Řádek 86: Řádek 86:
   | svazek = 92
   | svazek = 92
   | strany = 1619-49
   | strany = 1619-49
   | url = http://physrev.physiology.org/content/92/4/1619
   | url = https://www.physiology.org/doi/abs/10.1152/physrev.00046.2011
   | issn = 1522-1210
   | issn = 1522-1210
}}
}}
Řádek 97: Řádek 97:
   | url = http://pathinfo.wikia.com/wiki/CD117_%28c-kit%29
   | url = http://pathinfo.wikia.com/wiki/CD117_%28c-kit%29
   | citováno = 3/2014
   | citováno = 3/2014
}}  
}}


[[Kategorie:Biologie]]
[[Kategorie:Biologie]]
[[Kategorie:Molekulární biologie]]

Aktuální verze z 10. 1. 2025, 10:46

KIT je gen pro tyrozinkinázový receptor (CD117, SCFR, c-Kit) pro růstový faktor SCF. Zároveň jde o protoonkogen, který má i svůj virový protějšek v-Kit (virus sarkomu koček FeSV-4). Receptor c-Kit hraje důležitou úlohu v krvetvorbě, tvorbě melaninu, fertilitě a pohyblivosti střev. Poruchy signalizace zprostředkované receptorem c-Kit byly popsány v řadě patologický stavů, zejm. u některých nádorů a alergií, ale také např. u piebaldismu (parciální albinismus). Receptor c-Kit je možno farmakologicky blokovat.

Molekulární biologie[upravit | editovat zdroj]

Gen KIT[upravit | editovat zdroj]

Gen KIT se nachází na chromosomu 4 v segmentu 4q11. Gen je dlouhý více než 34 kb DNA, skládá se z 21 exonů. První exon kóduje inicializační sekvence, druhý až devátý exon kódují extracelulární část receptoru, desátý exon kóduje transmembránovou část receptoru a zbývající exony kódují intracelulární část receptoru. Promotorové sekvence genu KIT obsahují místa vázající regulační proteiny AP-2, bHLH, Sp1, Ets, Ets-2 a Myb.

Dalšími regulačními faktory podílejícími se na regulaci exprese genu KIT jsou miRNA (miR-221 a miR-222).

Struktura receptoru[upravit | editovat zdroj]

Receptor c-Kit je tyrozinkináza typu III, sruktura je velmi podobná ostatním receptorům této skupiny. Receptor prochází jednou přes membránu, extracelulárně je jeho N-terminální konec. Na receptoru lze rozlišit následující domény (postupně od N-terminálního konce):

  • pět imunoglobulinových domén,
  • GNNK sekvence (Gly-Asn-Asn-Lys sekvence),
  • transmembránová doména,
  • juxtamembránová doména,
  • tyrozinkinázová doména 1,
  • do kinázy vložená sekvence,
  • tyrozinkinázová doména 2,
  • C-terminální konec.

Alternativní sestřih mRNA vede k existenci několika variant receptoru. K alternativnímu sestřihu dochází ve dvou místech:

  • GNNK sekvence může být přítomna nebo nepřítomna,
  • v sekvenci vložené do kinázy může být vložen serinový zbytek.

Tedy existují nejmnéně čtyři isoformy receptoru. V postmeiotických zárodečných buňkách je dále přítomen výrazně zkrácený transkript tr-Kit, který je tvořen pouze druhou tyrozinkinázovou doménou a C-terminálním koncem.

Aktivace receptoru[upravit | editovat zdroj]

Model aktivovaného receptoru SCFR. Zeleně je vyznačen ligand, šedě dvojice proteinů c-Kit.

Receptor se aktivuje dimerizací. Ligand se musí navázat na imunoglobulinové domény 1–3. Tím se imunoglobulinové domény 4–5 přiblíží natolik, že mohou interagovat a navzájem se navázat. Následné přiblížení transmembránových domén a zřejmě i indukce změn v konformaci vedou k vzájemné fosforylaci tyrozinových zbytků juxtamembránových domén, sekvence vložené do kinázy a C-terminálního konce proteinu.


Deaktivace receptoru[upravit | editovat zdroj]

K deaktivaci receptoru slouží následující tři mechanismy:

  • odstranění receptoru z buněčného povrchu a následná degradace,
  • inaktivace tyrozinkinázové domény fosforylací na serinových zbytcích,
  • defosforylace tyrozinových zbytků.


Fyziologická funkce[upravit | editovat zdroj]

Receptor c-Kit má četné funkce během embryonálního vývoje i v dospělosti.

  • Krvetvorba. Receptor je exprimován v buňkách časných stádií krvetvorby, během vyzrávání exprese mizí. Signalizace z receptoru c-Kit je důležitým signálem podporujícím proliferaci a přežívání. V případě žírných buněk a dendritických buněk je receptor přítomen i u zralých buněk.
  • Pigmentace. Signalizace zprostředkovaná c-Kit receptorem podmiňuje přežívání, proliferaci a migraci melanocytů během embryogeneze.
  • Reprodukce. Signalizace zprostředkovaná receptorem c-Kit chrání zárodečné buňky před apoptózou, zprostředkovává jejich migraci a proliferaci. Signalizace c-Kit významným způsobem interaguje se signalizací ve dráze PI3K/Akt.
  • Gastrointestinální trakt. Signalizace c-Kit je klíčová pro Cajalovy intestinální buňky, bez dostatečné signalizace tyto buňky mizí a dochází k poruchám střevní motility.
  • Nervový systém. V pokusech na myších s porušenou funkcí receptoru c-Kit, resp. s mutací růstového faktoru SCF, byla prokázána porucha učení. Fyziologicky je KIT exprimován v oblastech neuroproliferace.
  • Kardiovaskulární systém. Signalizace SCF hraje roli v řadě fyziologických i patologických procesů zahrnujících diferenciaci srdečních kmenových buněk i konečnou diferenciaci kardiomyocytů a vaskulární proliferaci.
  • Plíce. U pokusných myší s defektním genem KIT se spontánně vyvíjí emfyzém a mění se mechanické vlastnosti plic. Příčina prozatím není známá, ale předpokládá se, že jde o vliv regulace zprostředkované c-Kit na úrovni plicního epitelu.


Molekulární patologie[upravit | editovat zdroj]

Nádorová onemocnění[upravit | editovat zdroj]

Mutace genu KIT byla prokázána u četných nádorů:

  • malobuněčný karcinom plic,
  • maligní melanom,
  • kolorektální karcinom,
  • gastrointestinální stromální tumor,
  • testikulární karcinom,
  • mastocytóza,
  • akutní myeloidní leukémie.

Imunitní poruchy[upravit | editovat zdroj]

Protože exprese genu KIT zůstává zachována u žírných buněk a u dendritických buněk, představuje signalizace zprostředkovaná c-Kit jeden z faktorů, který se může podílet na rozvoji astma a alergie, případně který může být zajímavým terapeutickým cílem.

Využití v histopatologii[upravit | editovat zdroj]

Protože je KIT mutován a/nebo změněným způsobem exprimován v celé řadě nádorů, jeho imunohistochemický průkaz je v některých případech cenným diagnostickým vodítkem. Histochemicky lze rozlišit několik vzorů barvení:

  • barvení membrán: řada nádorů, např. seminom;
  • cytoplazmatické barvení: gastrointestinální stromální tumor;
  • perinukleární tečkování (barvení Golgiho aparátu): gastrointestinální stromální tumor, seminom;
  • povrch lumin: adenoidně cystický karcinom.


Odkazy[upravit | editovat zdroj]

Literatura[upravit | editovat zdroj]


Externí odkazy[upravit | editovat zdroj]