KIT: Porovnání verzí
(kostra, snad se k tomu během příštího týdne dostanu...) |
m (→Gen KIT: obrahují → obsahují) |
||
(Není zobrazeno 6 mezilehlých verzí od 5 dalších uživatelů.) | |||
Řádek 1: | Řádek 1: | ||
'''KIT''' je gen pro tyrozinkinázový receptor (CD117, SCFR, c-Kit) pro růstový faktor [[SCF]]. Zároveň jde o [[ | '''KIT''' je gen pro tyrozinkinázový receptor (CD117, SCFR, c-Kit) pro růstový faktor [[SCF]]. Zároveň jde o [[protoonkogen]], který má i svůj virový protějšek v-Kit (virus sarkomu koček FeSV-4). Receptor c-Kit hraje důležitou úlohu v [[Hematopoeza|krvetvorbě]], tvorbě [[melanin]]u, fertilitě a pohyblivosti střev. Poruchy signalizace zprostředkované receptorem c-Kit byly popsány v řadě patologický stavů, zejm. u některých nádorů a alergií, ale také např. u [[Piebaldismus|piebaldismu]] (parciální albinismus). Receptor c-Kit je možno farmakologicky blokovat. | ||
== Molekulární biologie == | == Molekulární biologie == | ||
=== Gen KIT === | === Gen KIT === | ||
Gen KIT se nachází na chromosomu 4 v segmentu 4q11. Gen je dlouhý více než 34 kb DNA, skládá se z 21 exonů. První exon kóduje inicializační sekvence, druhý až devátý exon kódují extracelulární část receptoru, desátý exon kóduje transmembránovou část receptoru a zbývající exony kódují intracelulární část receptoru. Promotorové sekvence genu KIT | Gen KIT se nachází na chromosomu 4 v segmentu 4q11. Gen je dlouhý více než 34 kb DNA, skládá se z 21 exonů. První exon kóduje inicializační sekvence, druhý až devátý exon kódují extracelulární část receptoru, desátý exon kóduje transmembránovou část receptoru a zbývající exony kódují intracelulární část receptoru. Promotorové sekvence genu KIT obsahují místa vázající regulační proteiny [[AP-2]], [[bHLH]], [[Sp1]], [[Ets]], [[Ets-2]] a [[Myb]]. | ||
Dalšími regulačními faktory podílejícími se na regulaci exprese genu KIT jsou [[miRNA]] (miR-221 a miR-222). | Dalšími regulačními faktory podílejícími se na regulaci exprese genu KIT jsou [[miRNA]] (miR-221 a miR-222). | ||
Řádek 9: | Řádek 9: | ||
=== Struktura receptoru === | === Struktura receptoru === | ||
Receptor c-Kit je tyrozinkináza typu III, sruktura je velmi podobná ostatním receptorům této skupiny. Receptor prochází jednou přes membránu, extracelulárně je jeho N-terminální konec. Na receptoru lze rozlišit následující domény (postupně od N-terminálního konce): | Receptor c-Kit je tyrozinkináza typu III, sruktura je velmi podobná ostatním receptorům této skupiny. Receptor prochází jednou přes membránu, extracelulárně je jeho N-terminální konec. Na receptoru lze rozlišit následující domény (postupně od N-terminálního konce): | ||
* pět imunoglobulinových domén | * pět imunoglobulinových domén, | ||
* GNNK sekvence (Gly-Asn-Asn-Lys sekvence) | * GNNK sekvence (Gly-Asn-Asn-Lys sekvence), | ||
* transmembránová doména | * transmembránová doména, | ||
* juxtamembránová doména | * juxtamembránová doména, | ||
* tyrozinkinázová doména 1 | * tyrozinkinázová doména 1, | ||
* do kinázy vložená sekvence | * do kinázy vložená sekvence, | ||
* tyrozinkinázová doména 2 | * tyrozinkinázová doména 2, | ||
* C-terminální konec | * C-terminální konec. | ||
Alternativní sestřih mRNA vede k existenci několika variant receptoru. K alternativnímu sestřihu dochází ve dvou místech: | Alternativní sestřih mRNA vede k existenci několika variant receptoru. K alternativnímu sestřihu dochází ve dvou místech: | ||
* GNNK sekvence může být přítomna nebo nepřítomna | * GNNK sekvence může být přítomna nebo nepřítomna, | ||
* v sekvenci vložené do kinázy může být vložen serinový zbytek | * v sekvenci vložené do kinázy může být vložen serinový zbytek. | ||
Tedy existují nejmnéně čtyři isoformy receptoru. V postmeiotických zárodečných buňkách je dále přítomen výrazně zkrácený transkript tr-Kit, který je tvořen pouze druhou tyrozinkinázovou doménou a C-terminálním koncem. | Tedy existují nejmnéně čtyři isoformy receptoru. V postmeiotických zárodečných buňkách je dále přítomen výrazně zkrácený transkript tr-Kit, který je tvořen pouze druhou tyrozinkinázovou doménou a C-terminálním koncem. | ||
=== Aktivace receptoru === | === Aktivace receptoru === | ||
[[ | [[Soubor:Kit ligand 2E9W.png|náhled|250px|Model aktivovaného receptoru SCFR. Zeleně je vyznačen ligand, šedě dvojice proteinů c-Kit.]] | ||
Receptor se aktivuje dimerizací. Ligand se musí navázat na imunoglobulinové domény | Receptor se aktivuje dimerizací. Ligand se musí navázat na imunoglobulinové domény 1–3. Tím se imunoglobulinové domény 4–5 přiblíží natolik, že mohou interagovat a navzájem se navázat. Následné přiblížení transmembránových domén a zřejmě i indukce změn v konformaci vedou k vzájemné fosforylaci tyrozinových zbytků juxtamembránových domén, sekvence vložené do kinázy a C-terminálního konce proteinu. | ||
=== Deaktivace receptoru === | === Deaktivace receptoru === | ||
K deaktivaci receptoru slouží následující tři mechanismy: | K deaktivaci receptoru slouží následující tři mechanismy: | ||
* odstranění receptoru z buněčného povrchu a následná degradace | * odstranění receptoru z buněčného povrchu a následná degradace, | ||
* inaktivace tyrozinkinázové domény fosforylací na serinových zbytcích | * inaktivace tyrozinkinázové domény fosforylací na serinových zbytcích, | ||
* defosforylace tyrozinových zbytků | * defosforylace tyrozinových zbytků. | ||
=== Fyziologická funkce === | === Fyziologická funkce === | ||
Receptor c-Kit má četné funkce během embryonálního vývoje i v dospělosti. | Receptor c-Kit má četné funkce během embryonálního vývoje i v dospělosti. | ||
* '''Krvetvorba'''. Receptor je exprimován v buňkách časných stádií krvetvorby, během vyzrávání exprese mizí. Signalizace z receptoru c-Kit je důležitým signálem podporujícím proliferaci a přežívání. V případě [[Žírná buňka|žírných buněk]] a [[Dendritická buňka|dendritických buněk]] je receptor přítomen i u zralých buněk. | |||
Receptor je exprimován v buňkách časných stádií krvetvorby, během vyzrávání exprese mizí. Signalizace z receptoru c-Kit je důležitým signálem podporujícím proliferaci a přežívání. V případě [[Žírná buňka|žírných buněk]] a [[Dendritická buňka|dendritických buněk]] je receptor přítomen i u zralých buněk. | * '''Pigmentace'''. Signalizace zprostředkovaná c-Kit receptorem podmiňuje přežívání, proliferaci a migraci melanocytů během embryogeneze. | ||
* '''Reprodukce'''. Signalizace zprostředkovaná receptorem c-Kit chrání zárodečné buňky před apoptózou, zprostředkovává jejich migraci a proliferaci. Signalizace c-Kit významným způsobem interaguje se signalizací ve dráze [[PI3K]]/[[Akt]]. | |||
* '''Gastrointestinální trakt'''. Signalizace c-Kit je klíčová pro Cajalovy intestinální buňky, bez dostatečné signalizace tyto buňky mizí a dochází k poruchám střevní motility. | |||
Signalizace zprostředkovaná c-Kit receptorem podmiňuje přežívání, proliferaci a migraci melanocytů během embryogeneze. | * '''Nervový systém'''. V pokusech na myších s porušenou funkcí receptoru c-Kit, resp. s mutací růstového faktoru SCF, byla prokázána porucha učení. Fyziologicky je KIT exprimován v oblastech neuroproliferace. | ||
* '''Kardiovaskulární systém'''. Signalizace SCF hraje roli v řadě fyziologických i patologických procesů zahrnujících diferenciaci srdečních kmenových buněk i konečnou diferenciaci kardiomyocytů a vaskulární proliferaci. | |||
* '''Plíce'''. U pokusných myší s defektním genem KIT se spontánně vyvíjí emfyzém a mění se mechanické vlastnosti plic. Příčina prozatím není známá, ale předpokládá se, že jde o vliv regulace zprostředkované c-Kit na úrovni plicního epitelu. | |||
Signalizace zprostředkovaná receptorem c-Kit chrání zárodečné buňky před apoptózou, zprostředkovává jejich migraci a proliferaci. Signalizace c-Kit významným způsobem interaguje se signalizací ve dráze [[PI3K]]/[[Akt]]. | |||
Signalizace c-Kit je klíčová pro Cajalovy intestinální buňky, bez dostatečné signalizace tyto buňky mizí a dochází k poruchám střevní motility. | |||
V pokusech na myších s porušenou funkcí receptoru c-Kit resp. s mutací růstového faktoru SCF byla prokázána porucha učení. Fyziologicky je KIT exprimován v oblastech neuroproliferace. | |||
Signalizace SCF hraje roli v řadě fyziologických i patologických procesů zahrnujících diferenciaci srdečních kmenových buněk i konečnou diferenciaci kardiomyocytů a vaskulární proliferaci. | |||
U pokusných myší s defektním genem KIT se spontánně vyvíjí emfyzém a mění se mechanické vlastnosti plic. Příčina prozatím není známá, ale předpokládá se, že jde o vliv regulace zprostředkované c-Kit na úrovni plicního epitelu. | |||
== Molekulární patologie == | == Molekulární patologie == | ||
=== Nádorová onemocnění === | === Nádorová onemocnění === | ||
Mutace genu KIT byla prokázána u četných nádorů: | Mutace genu KIT byla prokázána u četných nádorů: | ||
* malobuněčný karcinom plic | * malobuněčný karcinom plic, | ||
* maligní melanom | * maligní melanom, | ||
* kolorektální karcinom | * kolorektální karcinom, | ||
* gastrointestinální stromální tumor | * gastrointestinální stromální tumor, | ||
* testikulární karcinom | * testikulární karcinom, | ||
* mastocytóza | * mastocytóza, | ||
* akutní myeloidní leukémie | * akutní myeloidní leukémie. | ||
=== Imunitní poruchy === | === Imunitní poruchy === | ||
Protože exprese genu KIT zůstává zachována u žírných buněk a u dendritických buněk, představuje signalizace zprostředkovaná c-Kit jeden z faktorů, který se může podílet na rozvoji astma a alergie, případně který může být zajímavým terapeutickým cílem. | Protože exprese genu KIT zůstává zachována u žírných buněk a u dendritických buněk, představuje signalizace zprostředkovaná c-Kit jeden z faktorů, který se může podílet na rozvoji astma a alergie, případně který může být zajímavým terapeutickým cílem. | ||
== Využití v histopatologii == | == Využití v histopatologii == | ||
Protože je KIT mutován a/nebo změněným způsobem exprimován v celé řadě nádorů, jeho imunohistochemický průkaz je v některých případech cenným diagnostickým vodítkem. Histochemicky lze rozlišit několik vzorů barvení: | Protože je KIT mutován a/nebo změněným způsobem exprimován v celé řadě nádorů, jeho imunohistochemický průkaz je v některých případech cenným diagnostickým vodítkem. Histochemicky lze rozlišit několik vzorů barvení: | ||
* barvení membrán: řada | * barvení membrán: řada nádorů, např. seminom; | ||
* cytoplazmatické barvení: gastrointestinální stromální tumor | * cytoplazmatické barvení: gastrointestinální stromální tumor; | ||
* perinukleární tečkování (barvení Golgiho aparátu): gastrointestinální stromální tumor, seminom | * perinukleární tečkování (barvení Golgiho aparátu): gastrointestinální stromální tumor, seminom; | ||
* povrch lumin: adenoidně cystický karcinom | * povrch lumin: adenoidně cystický karcinom. | ||
Řádek 99: | Řádek 86: | ||
| svazek = 92 | | svazek = 92 | ||
| strany = 1619-49 | | strany = 1619-49 | ||
| url = | | url = https://www.physiology.org/doi/abs/10.1152/physrev.00046.2011 | ||
| issn = 1522-1210 | | issn = 1522-1210 | ||
}} | }} | ||
Řádek 110: | Řádek 97: | ||
| url = http://pathinfo.wikia.com/wiki/CD117_%28c-kit%29 | | url = http://pathinfo.wikia.com/wiki/CD117_%28c-kit%29 | ||
| citováno = 3/2014 | | citováno = 3/2014 | ||
}} | }} | ||
[[Kategorie:Biologie]] | [[Kategorie:Biologie]] | ||
[[Kategorie:Molekulární biologie]] |
Aktuální verze z 10. 1. 2025, 10:46
KIT je gen pro tyrozinkinázový receptor (CD117, SCFR, c-Kit) pro růstový faktor SCF. Zároveň jde o protoonkogen, který má i svůj virový protějšek v-Kit (virus sarkomu koček FeSV-4). Receptor c-Kit hraje důležitou úlohu v krvetvorbě, tvorbě melaninu, fertilitě a pohyblivosti střev. Poruchy signalizace zprostředkované receptorem c-Kit byly popsány v řadě patologický stavů, zejm. u některých nádorů a alergií, ale také např. u piebaldismu (parciální albinismus). Receptor c-Kit je možno farmakologicky blokovat.
Molekulární biologie[upravit | editovat zdroj]
Gen KIT[upravit | editovat zdroj]
Gen KIT se nachází na chromosomu 4 v segmentu 4q11. Gen je dlouhý více než 34 kb DNA, skládá se z 21 exonů. První exon kóduje inicializační sekvence, druhý až devátý exon kódují extracelulární část receptoru, desátý exon kóduje transmembránovou část receptoru a zbývající exony kódují intracelulární část receptoru. Promotorové sekvence genu KIT obsahují místa vázající regulační proteiny AP-2, bHLH, Sp1, Ets, Ets-2 a Myb.
Dalšími regulačními faktory podílejícími se na regulaci exprese genu KIT jsou miRNA (miR-221 a miR-222).
Struktura receptoru[upravit | editovat zdroj]
Receptor c-Kit je tyrozinkináza typu III, sruktura je velmi podobná ostatním receptorům této skupiny. Receptor prochází jednou přes membránu, extracelulárně je jeho N-terminální konec. Na receptoru lze rozlišit následující domény (postupně od N-terminálního konce):
- pět imunoglobulinových domén,
- GNNK sekvence (Gly-Asn-Asn-Lys sekvence),
- transmembránová doména,
- juxtamembránová doména,
- tyrozinkinázová doména 1,
- do kinázy vložená sekvence,
- tyrozinkinázová doména 2,
- C-terminální konec.
Alternativní sestřih mRNA vede k existenci několika variant receptoru. K alternativnímu sestřihu dochází ve dvou místech:
- GNNK sekvence může být přítomna nebo nepřítomna,
- v sekvenci vložené do kinázy může být vložen serinový zbytek.
Tedy existují nejmnéně čtyři isoformy receptoru. V postmeiotických zárodečných buňkách je dále přítomen výrazně zkrácený transkript tr-Kit, který je tvořen pouze druhou tyrozinkinázovou doménou a C-terminálním koncem.
Aktivace receptoru[upravit | editovat zdroj]
Receptor se aktivuje dimerizací. Ligand se musí navázat na imunoglobulinové domény 1–3. Tím se imunoglobulinové domény 4–5 přiblíží natolik, že mohou interagovat a navzájem se navázat. Následné přiblížení transmembránových domén a zřejmě i indukce změn v konformaci vedou k vzájemné fosforylaci tyrozinových zbytků juxtamembránových domén, sekvence vložené do kinázy a C-terminálního konce proteinu.
Deaktivace receptoru[upravit | editovat zdroj]
K deaktivaci receptoru slouží následující tři mechanismy:
- odstranění receptoru z buněčného povrchu a následná degradace,
- inaktivace tyrozinkinázové domény fosforylací na serinových zbytcích,
- defosforylace tyrozinových zbytků.
Fyziologická funkce[upravit | editovat zdroj]
Receptor c-Kit má četné funkce během embryonálního vývoje i v dospělosti.
- Krvetvorba. Receptor je exprimován v buňkách časných stádií krvetvorby, během vyzrávání exprese mizí. Signalizace z receptoru c-Kit je důležitým signálem podporujícím proliferaci a přežívání. V případě žírných buněk a dendritických buněk je receptor přítomen i u zralých buněk.
- Pigmentace. Signalizace zprostředkovaná c-Kit receptorem podmiňuje přežívání, proliferaci a migraci melanocytů během embryogeneze.
- Reprodukce. Signalizace zprostředkovaná receptorem c-Kit chrání zárodečné buňky před apoptózou, zprostředkovává jejich migraci a proliferaci. Signalizace c-Kit významným způsobem interaguje se signalizací ve dráze PI3K/Akt.
- Gastrointestinální trakt. Signalizace c-Kit je klíčová pro Cajalovy intestinální buňky, bez dostatečné signalizace tyto buňky mizí a dochází k poruchám střevní motility.
- Nervový systém. V pokusech na myších s porušenou funkcí receptoru c-Kit, resp. s mutací růstového faktoru SCF, byla prokázána porucha učení. Fyziologicky je KIT exprimován v oblastech neuroproliferace.
- Kardiovaskulární systém. Signalizace SCF hraje roli v řadě fyziologických i patologických procesů zahrnujících diferenciaci srdečních kmenových buněk i konečnou diferenciaci kardiomyocytů a vaskulární proliferaci.
- Plíce. U pokusných myší s defektním genem KIT se spontánně vyvíjí emfyzém a mění se mechanické vlastnosti plic. Příčina prozatím není známá, ale předpokládá se, že jde o vliv regulace zprostředkované c-Kit na úrovni plicního epitelu.
Molekulární patologie[upravit | editovat zdroj]
Nádorová onemocnění[upravit | editovat zdroj]
Mutace genu KIT byla prokázána u četných nádorů:
- malobuněčný karcinom plic,
- maligní melanom,
- kolorektální karcinom,
- gastrointestinální stromální tumor,
- testikulární karcinom,
- mastocytóza,
- akutní myeloidní leukémie.
Imunitní poruchy[upravit | editovat zdroj]
Protože exprese genu KIT zůstává zachována u žírných buněk a u dendritických buněk, představuje signalizace zprostředkovaná c-Kit jeden z faktorů, který se může podílet na rozvoji astma a alergie, případně který může být zajímavým terapeutickým cílem.
Využití v histopatologii[upravit | editovat zdroj]
Protože je KIT mutován a/nebo změněným způsobem exprimován v celé řadě nádorů, jeho imunohistochemický průkaz je v některých případech cenným diagnostickým vodítkem. Histochemicky lze rozlišit několik vzorů barvení:
- barvení membrán: řada nádorů, např. seminom;
- cytoplazmatické barvení: gastrointestinální stromální tumor;
- perinukleární tečkování (barvení Golgiho aparátu): gastrointestinální stromální tumor, seminom;
- povrch lumin: adenoidně cystický karcinom.
Odkazy[upravit | editovat zdroj]
Literatura[upravit | editovat zdroj]
- LENNARTSSON, J. a L. RÖNNSTRAND. Stem cell factor receptor/c-Kit: from basic science to clinical implications. Physiol Rev. [online]. 2012, vol. 92, no. 4, s. 1619-49, dostupné také z <https://www.physiology.org/doi/abs/10.1152/physrev.00046.2011>. ISSN 1522-1210.
Externí odkazy[upravit | editovat zdroj]
- Pathology Resident Wiki. CD117 (c-kit) [online]. [cit. 3/2014]. <http://pathinfo.wikia.com/wiki/CD117_%28c-kit%29>.